Suivi des lignées et des destins cellulaires au cours de la régénération: imagerie en direct, marquage génétique et vulgarisation scientifique – TracMan

Les organismes multicellulaires sont formés de divers types de cellules, générées à partir de progéniteurs indifférenciés. Au cours de la régénération, ces diverses cellules doivent être recréées à partir de progéniteurs présents chez l'adulte. Découvrir leur lignage est essentiel pour comprendre comment les tissus/organes reproduisent ces organes au niveau cellulaire. Notre équipe a établi Parhyale hawaiensis comme modèle expérimental pour répondre à cette question. Ce crustacé a la capacité de régénérer ces pattes avec une grande fidélité en une semaine. Grâce à des lignées transgéniques exprimant des protéines fluorescentes, nous sommes capables de visualiser la régénération des pattes à une résolution cellulaire, suivant le lignage de cellules individuelles de l'amputation à la patte régénérée. L'objectif de ce projet est d'établir un flux de travail efficace pour suivre les progéniteurs de chaque type de cellule dans la jambe. Pour cela, nous allons (1) développer de nouveaux marqueurs fluorescents pour les types de cellules précis, (2) utiliser la microscopie à feuillet de lumière pour une imagerie quasi-isotropique à faible exposition lumineuse, (3) établir une approche de barcoding génétique chez Parhyale, adaptée pour l'analyse clonale des cellules localisées en profondeur, (4) collaborer avec des créateurs de jeux vidéo pour transformer le suivi de cellules en un jeu, afin d'améliorer son efficacité et faciliter le tracking participatif et la vulgarisation scientifique, (5) utiliser cette plateforme de jeu pour générer des données qui serviront à entraîner de logiciels de suivi de cellules basés sur l'intelligence artificielle, et (6) appliquer ces approches à l'identification des progéniteurs et des lignées cellulaires impliqués dans la régénération des organes sensoriels. Les organes sensoriels serviront de test pour l'analyse des progéniteurs de chaque type de cellule.