Identifier la réponse du répertoire chez les souris sauvages – WILDTYPES

La prédiction quantitative de la réponse des répertoires immunitaires des vertébrés aux infections virales est essentielle pour la conception éclairée de vaccins, de thérapies et d'outils de diagnostic. L'échantillonnage des lymphocytes T présents chez un individu donné nous donne un enregistrement unique des conditions pathologiques en cours et récentes. Les progrès récents des techniques de séquençage à haut débit nous permettent d'obtenir ces enregistrements d'infection directement à partir d'un seul échantillon de sang. Cependant, sa lecture n'est pas aisée puisque les réponses sont statistiques et qu'il existe de nombreuses solutions tout aussi bonnes pour un même problème antigénique. Bien que des données soient disponibles pour l'homme, il est beaucoup plus difficile de comprendre la reproductibilité et la convergence des réponses dans ces cas, et de se connecter à des modèles immunologiques connus qui sont principalement développés chez la souris. En combinant les données de séquençage de répertoire à haut débit, l'analyse de données statistiques et la théorie avec des expériences de re-sauvage de pointe, notre objectif est de caractériser la réponse des répertoires immunitaires des lymphocytes T aux infections affectant les souris dans la nature.