Impact des changements de régimes alimentaires sur l'interaction génome-microbiome des Océaniens – NUTRIOCEO

Depuis des milliers d'années, l'interaction entre l'alimentation, le génome et le microbiome humain a conduit les populations à être biologiquement adaptées à certains régimes alimentaires. Bien que cette coévolution soit une clé d'une alimentation durable et saine, nos connaissances sont largement limitées aux populations européennes, augmentant les inégalités entre les pays occidentaux et les pays en développement. En Océanie, les populations de Papouasie-Nouvelle-Guinée (PNG) sont héritières de 50 000 ans d’interaction avec un environnement unique, dont elles ont extrait des ressources alimentaires spécifiques. La gestion de leur environnement a mené à l'invention de pratiques agricoles il y a environ 8 000 ans. Malgré cette histoire intriquée avec les ressources locales, les populations de PNG souffrent souvent de malnutrition, notamment dans les zones urbaines où la nourriture industrielle est très consommée.
Le projet NUTRIOCEO vise à caractériser l'interaction génome-microbiome-alimentation en PNG, par une approche multidisciplinaire combinant l'anthropologie de la nutrition, la génomique et la microbiologie. Nous analyserons les variants génétiques, la diversité du microbiome oral et intestinal, et les données alimentaires de 300 participants de PNG dans des zones rurales et urbaines. Les objectifs sont (1) de caractériser les adaptations génétiques liées aux changements historiques de régime alimentaire en PNG ; (2) déterminer la diversité microbienne orale et intestinale en PNG et son lien avec l'alimentation ; (3) identifier les associations entre les adaptations génétiques et les espèces microbiennes liées au régime alimentaire ; (4) évaluer l'impact d'une alimentation urbaine sur l'interaction génome-microbiome-alimentation. Le projet NUTRIOCEO dévoilera des mécanismes coévolutifs importants pour la santé humaine à notre époque marquée par les changements climatiques et la problématique de la disponibilité des ressources alimentaires.