Définition et validation préclinique de probiotiques spécifiques du microbiote respiratoire pour le traitement des pneumonies – Symbiolung

Contexte: La pneumonie est la principale cause de maladies transmissibles et la deuxième cause d'années d'incapacité prolongée dans le monde. Elle peut être acquise dans le milieu communautaire ou lors d'une hospitalisation. Les pneumonies sévères évoluent fréquemment vers un syndrome de détresse respiratoire aigu, dont 25 à 35% n’évoluent pas favorablement. Notre équipe propose une réévaluation de la physiopathologie de la pneumonie. Nous émettons l'hypothèse que la restauration de la composition et des fonctions du microbiome respiratoire pourrait restaurer l'homéostasie pulmonaire et améliorer la réponse au traitement.
Objectifs: Nos principaux objectifs sont de définir au niveau de l’espèce un consortium commensal dont l'altération sera associée à la gravité de la pneumonie, de décrire la production de métabolites et de peptides par ce consortium, de tester les effets d'un cocktail probiotique composé de ce consortium spécifique sur la prolifération des agents pathogènes, sur la composition du microbiome et sur l'immunité de la muqueuse pulmonaire.
Méthodes: Grâce à l'intégration de données multi-omiques, nous définirons un consortium composé d'espèces bactériennes, de métabolites et de peptides qui seront associés à la gravité de la pneumonie et à l'échec du traitement. Nous étudierons ensuite in vitro et dans des modèles murins leurs effets sur la modulation des mécanismes de coopération bactérienne et sur l’inhibition de la croissance du pathogène, ainsi que sur les défenses immunitaires de l’hôte.
Perspectives: Le projet SYMBIOLUNG aidera à définir les médiateurs commensaux impliqués dans l'homéostasie pulmonaire, comblant ainsi un manque de connaissances essentiel au développement d'approches ciblées sur le microbiome pulmonaire. Ainsi, si notre hypothèse est démontrée, l’impact de nos travaux sera important pour les patients atteints de pneumonie et pour les professionnels de santé, compte tenu du nombre de patients cibles.