Révéler l'origine des autophagosomes – Omegafold

L'autophagie est un système de recyclage cellulaire polyvalent qui assure l'homéostasie cellulaire en dégradant les composants
cytosoliques endommagés ou indésirables. Le stress cytotoxique induit la formation d'autophagosomes qui dégradent tous les
constituants du cytoplasme. Ces autophagosomes non sélectifs émergent de membranes qui sont réputées provenir du réticulum endoplasmique.
Le mode de formation de ces membranes, appelées omégasomes, reste inconnu. Nous avons développé un système modèle unique
qui nous permet d'étudier la formation des omégasomes. En ciblant un composant clé de la machinerie d'autophagie à la
membrane plasmique, nous avons induit la formation des omégasomes à cette membrane. Nos données préliminaires montrent que i) les
omégasomes sont formés par la fusion de petites vésicules donneuses, ii) des composants clés impliqués dans l'initiation de
l'autophagie contrôlent le recrutement et la fusion de ces vésicules et iii) les phagophores émergent par remodelage des membranes d'omégasomes.
Sur la base de ces observations, nous proposons un programme de recherche ambitieux et pluridisciplinaire pour
étudier "l'origine des autophagosomes". Nous utiliserons une combinaison d'approches d'imagerie en cellules vivantes, d'optogénétique,
d'imagerie de vie de fluorescence, de microscopie électronique 3D, de microscopie corrélative photonique/électronique et de biochimie pour révéler (i) comment les
omégasomes se forment, (ii) quels mécanismes moléculaires sont impliqués, (iii) l'origine des lipides nécessaires à
leur formation et (iv) comment les omégasomes favorisent la formation des phagophores.