Disséquer la spécificité des ORP3 dans le trafic lipidique et l'autophagie chez les plantes au cours du développement et en réponse aux stress – ORPhagy

La macroautophagie consiste en la formation de vésicules spécialisées (autophagosomes) qui séquestrent puis délivrent des composants cellulaires dans la vacuole lytique pour dégradation. Les autophagosomes se forment de novo grâce à un processus en plusieurs étapes, réalisé par les protéines ATG. En situation de stress, des milliers d’autophagosomes se forment rapidement, nécessitant un apport de lipides conséquent pour leurs membranes. En plus d’être des éléments constitutifs, les lipides sont également importants en termes de qualité. Leurs nature et propriétés physico-chimiques régissent l'identité, l’activité, l'architecture et la dynamique des membranes. La manière dont les lipides sont mobilisés vers la formation/expansion des autophagosomes reste une question ouverte. Le transfert de lipides du RE vers le phagophore est probablement un élément majeur de l’expansion de cette membrane et plusieurs éléments indiquent que différentes populations d’autophagosomes se forment, décorées par des protéines ATG8 distinctes. La formation d'autophagosomes spécifiques requière-elle une machinerie et une source d'apport de lipides spécifiques ? Les deux laboratoires partenaires impliqués dans cette proposition ont rassemblé plusieurs éléments qui montrent qu’une famille spécifique de protéines de transfert lipidique (LTP) pourrait participer à la dynamique membranaire nécessaire à la formation des autophagosomes.
Nous étudierons la manière dont les lipides sont mobilisés pour former les autophagosomes selon les tissus/types cellulaires/stress environnementaux, en explorant la fonction et la spécificité des candidats LTP identifiés. Nous allons (1) décortiquer la spécificité d’expression, de localisations et d’interactions des LTP aux différentes échelles ; (2) caractériser leurs activités et leurs fonctions dans la voie de l'autophagie et (3) explorer l'importance des interactions spécifiques LTP/autophagie au cours du développement et en réponse aux stress.