Rôle de la vitesse de la transcription par l'ARN polymérase II – SPEEDREG

La réponse des cellules à des stimuli intra- ou extra-cellulaires est associée à des changements significatifs dans la composition du transcriptome qui contribuent à la réponse et à l'adaptation des cellules à ces stimuli. La vitesse de transcription par l'ARN polymérase (Pol) II peut contrôler les processus de maturation co-transcriptionnels tels que l'épissage, la polyadénylation et la terminaison de la transcription, régulant ainsi la production de variants d'épissage alternatifs, d'ARN circulaires, de transcrits alternativement polyadénylés ou de transcrits read-through. Néanmoins, l'étendue de la régulation de la vitesse de la transcription et ses conséquences sur le transcriptome en réponse à des stimuli intra- ou extra-cellulaires restent inconnues. Nous proposons ici de déterminer l'étendue de la régulation de la vitesse de la transcription en cartographiant globalement les changements de vitesse de l'ARN Pol II dans un contexte dynamique. Nous déterminerons comment la vitesse de l'ARN Pol II est adaptée en identifiant les facteurs impliqués dans sa régulation. Enfin, nous caractériserons les conséquences des changements de vitesse de l'ARN Pol II sur le transcriptome dans une situation pathologique et nous chercherons à déterminer si ces changements jouent un rôle dans la progression de cette pathologie. Ce projet nous permettra de définir si ce paramètre peu étudié du cycle de transcription joue en fait un rôle essentiel dans le devenir cellulaire.