Variation naturelle de la mémoire épigénétique transgénérationnelle chez C. elegans – EpiCE

L'hérédité épigénétique est généralement moins stable dans le temps que l'hérédité portée par la séquence d'ADN, ce qui soulève des questions quant à son importance et sa variation évolutive. Une forme d'hérédité épigénétique, trouvée en particulier chez le nématode C. elegans, est la mémoire transgénérationnelle médiée par des petits ARNs réprimant l'expression de gènes spécifiques. Une question clé est de savoir si de tels mécanismes de transmission épigénétique varient au sein d'une espèce, ce qui forme une condition préalable à l'étude évolutive de la sélection pouvant agir sur cette mémoire. Nous proposons d'étudier la variation naturelle entre souches sauvages de C. elegans dans la durée de la mémoire épigénétique médiée par les petits ARNs. En complement, cette variation de la durée de la mémoire n’a d’importance que si les petits pools d’ARN varient parmi les isolats naturels de C. elegans (même en l’absence de variation génomique). Les trois objectifs principaux de ce projet sont:
1. Tester au laboratoire la présence d'une variation dans la durée de la mémoire de l'interférence à ARN entre des souches sauvages de C. elegans et dans différents environnements.
2. Déterminer la base génétique de la variation de la mémoire épigénétique entre souches sauvages de C. elegans, en utilisant des approches de génomique, génétique quantitative et biologie moléculaire.
3. Tester la variation épigénétique des petits ARNs entre des lignées isogéniques d'animaux nouvellement isolés de la nature et le maintien du profil au fil des générations en laboratoire.
Ce projet aborde les processus fondamentaux de l'hérédité et de l'évolution, au cœur de la biologie. Les deux équipes combinées, avec leur expertise respective et leur accès aux ressources, se trouvent dans une situation unique pour étudier la variation naturelle des mécanismes basés sur les petits ARN.