Comprendre pourquoi differentes configurations donnent des resultats differents en neurosciences – VICUNA

Les pipelines de traitement des données sont au cœur des sciences expérimentales modernes. Du nettoyage des données à l'analyse statistique, ils couvrent les étapes essentielles qui transforment les données brutes non traitées en découvertes scientifiques. Mais dans la pratique, les chercheurs sont confrontés à un paysage de pipelines très complexe - différents modèles, outils, algorithmes, paramètres - et des études récentes ont souligné que le choix exact du pipeline peut conduire à des résultats de recherche contradictoires.

Ce phénomène a un impact sur de nombreux domaines de la recherche expérimentale et le domaine du génie logiciel s'intéresse de près à ce problème. Ces dernières années, ils ont proposé des modèles pour aider à la compréhension de l'espace des pipelines. Pourtant, de nombreux domaines expérimentaux travaillent encore sur ce sujet de manière isolée, au risque de réinventer la roue.

VICUNA apportera des approches de génie logiciel de pointe pour explorer l'espace des pipelines dans le domaine de l'imagerie cérébrale. Pour permettre une exploration automatique à grande échelle de l'espace des pipelines et combler le fossé avec le génie logiciel, VICUNA modélisera l'espace des pipelines de neuro-imagerie comme un modèle de caractéristiques. Dans ce but, VICUNA se concentrera sur trois objectifs : 1/ Modéliser l'espace analytique, 2/ Enregistrer la provenance et 3/ Explorer l'espace analytique pour étudier les principales sources de variabilité.

VICUNA fournira une preuve de concept pour apporter des résultats plus reproductibles en imagerie cérébrale. Ce projet ne sera possible que par une compréhension approfondie des pipelines existants et par une collaboration entre les communautés de recherche en imagerie cérébrale et en génie logiciel.