Abstraction des Réseaux de Réactions vers des Réseaux Booléens pour Améliorer l'Inférence et le Contrôle en Biologie des Systèmes – REBON
Nous proposons de développer des abstractions des réseaux de réactions en réseaux booléens utilisant la sémantique la plus permissive. L'objectif est d'améliorer l'inférence des réseaux depuis des données et le contrôle de réseaux modélisant des systèmes biologiques. Nous considérons deux cas d'applications : le premier concerne la compréhension de l'évolution des communautés de microalgues en écologie marine et le second, le contrôle du métabolisme de l'organisme modèle Bacillus subtilis à l'aide de knockouts de gènes afin de surproduire des lipopeptides antimicrobiens utilisables en agroécologie.
Coordination du projet
Joachim NIEHREN (Centre Inria de l'Université de Lille)
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Partenariat
UMR 9189 - CRISTAL - Centre de Recherche en Informatique, Signal et Automatique de Lille
LaBRI Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique
Inria Centre Inria de l'Université de Lille
Aide de l'ANR 551 723 euros
Début et durée du projet scientifique :
- 60 Mois
