Analyse à l'échelle de la cellule unique à base d'outils moléculaires fluorescents pour prédire la résistance et la virulence de bactéries pathogènes dans des produits laitiers – FluoPath

Les objectifs du projet FLUOPATH sont 1) de déterminer de nouveaux biomarqueurs (promoteurs induisant l'expression de gènes d'intérêt) couplés à un biosenseur fluorescent permettant d'acquérir de nouvelles connaissances de l'état physiologique de cellules bactériennes en lien avec l'impact de perturbations technologiques liées à des stress. L'étude portera sur la croissance, la survie et la virulence de deux pathogènes en milieux laitiers (lait, fromage modèle dilué et si fromage modèle solide) et 2) d'utiliser ces connaissances combinées aux connaissances présentes dans la littérature scientifique pour améliorer les modèles de prédiction du risque microbiologique dans les produits laitiers.
Les pathogènes considérés seront L. monocytogenes et B. cereus. Les matrices considérées seront le lait liquide ainsi qu'un fromage modèle dilué et non dilué (sous forme de gel). De nouveaux modèles basés sur l'utilisation à l'échelle de la cellule unique et de la population entière de biomarqueurs seront développés pour prédire la croissance, la résistance et la virulence (capacité invasive pour L. monocytogenes et entrée en sporulation et production de toxine pour B. cereus) au stress tout en tenant compte de la variabilité cellulaire. Une quantification précise de l'impact des conditions industrielles stressantes sera effectuée sur les réponses bactériennes au niveau cellulaire: probabilité de croissance unicellulaire / population entière, survie, production de toxines, formation de spores, capacité invasive. Le défi consiste à concevoir et valider dans les matrices alimentaires des biomarqueurs bactériens de phénotypes d'intérêt dans l'évaluation des risques afin d'intégrer l'intensité de la réponse des biomarqueurs dans les modèles d'évaluation de l'exposition.