Un biocondensat unissant nanovésicules et gouttelettes lipidiques – LipidCondensate
Les gouttelettes lipidiques forment des organites uniques dans la cellule constitués d'un noyau de lipides neutres entouré d'une monocouche de phospholipides et de protéines. Les gouttelettes constituent la principale source de carbone de la cellule et peuvent être utilisées pour diverses voies métaboliques, notamment la synthèse des lipides et la production d'ATP. Nous avons récemment observé que la protéine TPD54, peu caractérisée mais abondante, favorise la formation d'une nouvelle structure dans la cellule : un biocondensat où les gouttelettes lipidiques sont entourées d'une matrice dense de vésicules très petites (diamètre 30-40 nm). Comme ce condensat piège également des scramblases potentielles et des protéines de transfert de lipides, nous supposons qu'il forme une plateforme dynamique d'échange de lipides qui permettrait à la cellule de disposer non seulement d'une forte densité de lipides neutres, par le biais des gouttelettes lipidiques, mais aussi d'une forte densité de lipides formant des bicouches, par le biais des nanovésicules. Le but de ce projet est de caractériser ce biocondensat complexe par la reconstitution biochimique, des mesures de dynamique dans les cellules, des essais de proximité et la microscopie optique et électronique corrélative. Des approches d'ingénierie des protéines, de pharmacologie et de génétique seront utilisées pour déterminer la base moléculaire de la formation du biocondensat induite par le TPD54, notamment le rôle de sa région centrale coiled-coil, de ses hélices amphipathiques C-terminales et de la phosphorylation d'un résidu clé. Le marquage fluorescent in vitro et in vivo sera utilisé pour déterminer la dynamique des protéines et des lipides dans les condensats ternaires; notamment la direction du flux de lipides entre la phase neutre et la phase polaire. Ce projet devrait permettre de mieux comprendre une nouvelle structure responsable du stockage proche des lipides neutres et amphiphiles dans la cellule.
Coordination du projet
Bruno ANTONNY (Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire)
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Partenariat
CCMA Centre Commun de Microscopie Appliquée
Biologie cellulaire et Cancer, UMR144
IPMC Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire
Aide de l'ANR 509 826 euros
Début et durée du projet scientifique :
septembre 2023
- 48 Mois