Explorer les facteurs de l’isolement reproductif au cours des radiations évolutives chez les plantes – RadiaSpe

Certaines branches de l'arbre du vivant sont représentées par un nombre plus élevé d'espèces par rapport aux autres. Cela se produit lorsque le taux d'émergence de nouvelles espèces (spéciation) dépasse nettement celui de leur disparition. Cependant, il est difficile de savoir si ces radiations sont simplement dues à une augmentation des opportunités écologiques ou si un potentiel génomique élevé est nécessaire, lié à des événements démographiques et/ou à l'évolution du génome. Le projet RadiaSpe vise à comprendre la dynamique de diversification des espèces en étudiant deux genres de plantes éloignés, étudiés par le partenaire autrichien: Tillandsia (Bromeliaceae) et Diospyros (Ebenaceae). En utilisant des outils de génomique des populations (développés par le partenaire français), nous comparerons la dynamique de spéciation entre les clades avec et sans radiation, dans le but de comprendre les processus génomiques et écologiques en oeuvre pendant les radiations. Plus précisément, nous testerons si (1) les génomes des espèces radiées ont accumulé des barrières reproductives plus rapidement; (2) la spécialisation écologique (chimie du sol, pollinisateurs, etc.) est un facteur causal; (3) les réarrangements chromosomiques et éléments transposables sont surreprésentés dans leurs génomes. Le projet bénéficiera de génomes entiers récemment séquencés par le partenaire Autrichien chez 350 accessions échantillonnées issues de populations naturelles de Tillandsia et Diospyros, et de 8 génomes nouvellement acquis. L'objectif de RadiaSpe est de créer une synergie entre des laboratoires appliquant des approches complémentaires avec des intérêts scientifiques convergents : génomique écologique à partir d'un travail de terrain intensif (partenaire autrichien) et développement d'outils informatiques en génomique des populations (partenaire français). Cette synergie scientifique est un atout majeur du projet qui nous aidera à aborder une question centrale en biologie évolutive.