DockEvol: utiliser les ports comme des laboratoires darwiniens pour étudier l'évolution marine dans l'Anthopocène – DockEvol

DockEvol vise à poser les fondations d’un projet à long terme dédié à l’étude de la "portuarisation biologique", définie comme l'évolution des espèces marines dans les écosystèmes portuaires sous l’influence de pressions sélectives anthropiques. Des ports, toujours plus grands et plus nombreux, ont été construits partout. Ces nouveaux habitats sont comme des mésocosmes géants, souvent isolés de la mer ouverte par des écluses, où les espèces évoluent dans un environnement abiotique nouveau, et au sein d'un assemblage inédit d'espèces exotiques et indigènes qui parfois s'hybrident et se métissent. Nous voyons les ports comme des laboratoires darwiniens dans lesquelles des expériences évolutives se répliquent sur des échelles de temps modérées. DockEvol cible trois espèces présentant des indices de portuarisation et étudiées dans des sites de fond, de milieu et d’avant-port dans six ports ateliers. Notre but est d’étudier le tryptique génotype-phénotype-environnement, à la base de la compréhension des processus évolutifs. Nous utiliserons le séquençage de génomes par la méthode haplotagging, l'indice de condition et le profilage du microbiome, et l’environnement abiotique ainsi que biotique par metabarcoding d’ADNe. Nous construirons un modèle de paysages de fitness, ajustés à des cartes génotype-phénotype contrôlées pour les variations environnementales. Enfin, des expérimentations en laboratoire seront menées pour étudier les effets fonctionnels de deux variations génétiques candidates que nous avons récemment identifiés dans les populations portuarisées de deux espèces du projet: 15 répétitions en tandem d'un gène du cytochrome P450 chez Ciona, et deux changements radicaux d'acides aminés du gène period chez Mytilus. DockEvol analysera comment l'environnement portuaire façonne les pressions de sélection et modifie la démographie et le mouvement des espèces au sein des paysages anthropisés.