Détection instantanée de la lyse bactérienne induite par l'action d'un bactériophage – SUPPLY

La multi-résistance bactérienne se propage rapidement et, en l'absence de nouvelles approches, 10 millions de victimes par an sont envisagées d'ici 2050. La phagothérapie, c'est-à-dire l'utilisation thérapeutique de virus bactériens appelés bactério(phages), est actuellement fortement étudiée pour son potentiel à lutter contre les infections bactériennes lorsque les antibiotiques ne sont plus efficaces. Cependant, une approche personnalisée est souhaitable en raison de la grande spécificité des phages et de problèmes de stabilité de cocktails de phages pré-assemblés. Une telle stratégie personnalisée nécessite non seulement une compréhension approfondie de l'interaction phage-bactérie mais aussi la capacité de sélectionner rapidement le(s) bon(s) phage(s) pour le bon patient. Dans ce contexte, SUPPLY vise à développer une nouvelle méthodologie interdisciplinaire basée sur des microsystèmes biophotoniques pour l'étude approfondie des interactions phages-bactéries. Un premier objectif de SUPPLY est de développer des microrésonateurs optiques pour le piégeage non destructif de bactéries et de phages pour une caractérisation fine de l'interaction des phages avec une seule bactérie. De telles expériences offrent la possibilité d’une détection photonique ultra-rapide de la lyse bactérienne par les phages en apportant de nouvelles connaissances sur les principes fondamentaux des interactions phage-bactéries et leurs signatures optiques. Ainsi, un deuxième objectif est de fournir des outils en rupture pour le criblage rapide des banques de phages afin de sélectionner les phages les plus actifs, ouvrant la voie à l'application d'une nouvelle technologie capable de réduire le temps nécessaire pour sélectionner le(s) bon(s) phage(s) pour les patients. Dans un troisième objectif, SUPPLY vise à initier la biophysique des phages en étudiant l'interaction phage-bactérie du point de vue de la bactérie unique et du phage unique. Par conséquent, SUPPLY contribuera à soutenir la mise en œuvre de la phagothérapie en fournissant aux microbiologistes et aux médecins un nouvel outil pour le succès thérapeutique. SUPPLY rassemble un consortium multidisciplinaire d'équipes expertes très complémentaires dans les domaines de la biologie et de la thérapie des phages (CHUV, Lausanne & CEA-LETI-DTBS, Grenoble), de la photonique et de l'instrumentation optique (EPFL, Lausanne & CEA-IRIG, Grenoble) et de la micro- nanofabrication (LTM-CNRS hébergé par le CEA-LETI, Grenoble).