Rôle des variants d'histones et de leurs modifications dans la réorganisation de la chromatine et la reprogrammation transcriptionnelle lors de la germination – SeedChrom

Les graines sont essentielles pour l'alimentation humaine, la dispersion des plantes et la conservation des espèces. Métaboliquement inerte, la graine sèche subit une reprogrammation importante de l'expression génique et de l'organisation chromatinienne au cours de la germination. Les nucléosomes constituent le premier degré d'organisation de la chromatine, cependant, leur composition ainsi que leurs modifications dans l'embryon végétal ne sont que très peu caractérisées. Des publications récentes ainsi que nos données non publiées montrent que dans la graine, la chromatine est enrichie en variants spécifiques du type H3 et H2B et contient des niveaux faibles de la forme ubiquitinée de l'histone H2B. Cette organisation spécifique de la chromatine de la graine est rapidement et profondément remodelée lors de son imbibition. Nos données préliminaires démontrent également que plusieurs caractéristiques de la graine, comme sa dormance, sa longévité et sa germination en conditions de stress sont altérées chez les mutants déficients pour le dépôt du variant d’histone H3.3 ou chez les mutants impliqués dans l’ubiquitination d’H2B. Grâce à des approches génétiques, épigénomiques et microscopique, notre programme de recherche permettra d’élucider les mécanismes moléculaires expliquant ces phénotypes et de mieux comprendre comment cette organisation chromatinienne particulière est reprogrammée au cours de la germination de la graine. Ces approches seront complémentées par des cribles, avec et sans a priori, avec pour objectif d'identifier de nouveaux acteurs chromatiniens déterminants pour la vigueur des graines.