Décrypter les rôles du métabolisme Halogéné dans une algue brune modèle par des approches de génomique fonctionnelle – HaloGene

Le métabolisme halogéné jouerait un rôle essentiel dans la biologie des macroalgues, mais les voies de biosynthèse spécifiques, la biochimie des enzymes impliquées et les fonctions in vivo sont mal connues. Le projet HaloGene vise à étudier les fonctions biologiques des enzymes clés de l’halogénation, chez l'algue brune modèle Ectocarpus, par génomique fonctionnelle. Nos objectifs sont i) de générer des knock-outs (KO) de gènes par la méthode CRISPR-Cas9, dont ceux codant les haloperoxydases à vanadium, ii) de comparer les profils métaboliques et transcriptomiques des algues sauvages et mutantes, iii) d'analyser les effets du KO des gènes sur le microbiome associé et les réponses physiologiques des algues soumises à différents stress abiotiques et biotiques, et iv) d'étudier l'origine, l'évolution et la distribution des enzymes du métabolisme halogéné chez les algues brunes. Ce projet permettra de mieux comprendre l’halogénation et le rôle des composés halogénés dans la biologie des algues.