Développement de la cryo-tomographie électronique à transmission en balayage faible dose en utilisant des images parcimonieuses, pour étudier les cellules eucaryotes entières à l'échelle du nanomètre – C-STET-4-E-Cells

Le projet C-STET-4-E-Cells vise à développer une méthode originale de cryo-tomographie électronique en mode balayage (cryo-STET) utilisant des images parcimonieuses pour des applications faible dose en biologie. Le but est de proposer à la communauté de biologie structurale une nouvelle méthode pour l’étude 3D des macro-complexes dans leur environnement cellulaire. Actuellement, les méthodes de cryo-tomographie sont limitées à l’étude des échantillons inférieurs à 300 nm. Avec la cryo-STET, la limite dépassera 1 µm afin d’explorer les cellules eucaryotes. Pour respecter l’intégrité de l’échantillon, nous utiliserons de faibles doses d’électrons en collectant des images incomplètes. L’information manquante, c'est à dire les pixels qui n'ont pas été collectés, sera reconstruite en utilisant des algorithmes d’inpainting et d'intelligence artificielle. Nous appliquerons la méthode sur l'analyse de la distribution et de la structure des particles de transport intraflagellaire du parasite eucaryote unicellulaire, T. brucei, pour montrer les fortes possibilités d’applications de la méthode.