Échange hydrogène-deutérium couplé à la spectrométrie de masse des acides nucléiques – DNA-HDXMS

Alors que l’échange hydrogène-deutérium couplé à la spectrométrie de masse (HDX/MS) est relativement répandu pour étudier la dynamique de protéines, il n'est actuellement pas du tout exploité pour étudier les acides nucléiques. Nos résultats préliminaires montrent cependant qu’il s’y prête, offrant des perspectives pour explorer la structure et dynamique d’acides nucléiques, et leurs interactions avec des protéines. Le projet vise à établir les bases permettant d'interpréter les résultats en termes d'équilibre et de dynamique, en établissant les fondamentaux des cinétiques HDX/MS d’acides nucléiques. Nous développerons aussi une approche HDX/MS native top-down, qui couplera une séparation par MS native (par masse et forme) et une fragmentation MS/MS pour obtenir des données à l’échelle du nucléotide. Enfin, nous explorerons des applications en sciences de la vie (influence de ligands sur la dynamique des G-quadruplexes, et contrôle qualité d’oligonucléotides thérapeutiques).