Couplage Electrophorèse capillaire-mobilité ionique-spectrométrie de masse pour la caractérisation d’isomères de glycoprotéines – MIOSEC

La glycosylation est une modification post-traductionnelle régulée par des enzymes, dont l’activité et le niveau d’expression peuvent être affectés par les conditions physiologiques et pathologiques. L’étude de leur structure, de la séquence primaire de la protéine associée à la composition de la chaîne glycosidique est alors cruciale et un défi important à relever.
Le projet MIOSEC proposé ici a pour but de développer une méthodologie analytique nouvelle permettant d’identifier et de caractériser les glycoprotéines et les glycopeptides d’une manière simple. Le projet décrit un nouveau type de couplage entre la Mobilité IOnique associée à la Spectrométrie de masse et l’Electrophorèse Capillaire pour l’analyse des glycoprotéines et glycopeptides (CE-IMS-MS coupling). Bien que le concept soit déjà existant, ce couplage est particulièrement intéressant par son côté innovant car n’étant pas réellement établi sur des appareils commerciaux et devrait permettre des résultats complets en une analyse simple et relativement rapide. Ce couplage sera mis en place au niveau instrumental (WP0) avant une optimisation des différents paramètres pour l’analyse d’un mélange complexe de glycopeptides issu de venins de Conus striatus (WP1). Les protéines glycosylées seront aussi étudiées en utilisant ce couplage CE-IMS-MS afin de caractériser un profil de différentes conformations d’anticorps monoclonaux thérapeutiques (WP2). Enfin, une partie du projet sera consacrée à la création d’une base de données avec les différents paramètres issus de ce couplage tels que la mobilité électrophorétique, le rapport m/z, le temps de dérive (drift time) obtenus lors de ces analyses afin d’aider à identifier les glycopeptides et glycoprotéines (WP3).
Ce projet sera porté par un chercheur ayant les compétences et le niveau scientifique adaptés combiné à l’environnement du laboratoire ayant une expertise en séparation électrophorétique et en spectrométrie de masse des biomolécules.