Les Long non coding RNAs en tant que régulateurs des microARN : Un mécanisme de comptage pour la production de neurones ? – UNCODING

La neurogenèse est un processus hautement orchestré sur le plan temporel et quantitatif. Dans les premières phases, les cellules souches neurales se divisent de manière symétrique afin d'amplifier un pool de progéniteurs de glie radiaire de taille précise. Puis, ces progéniteurs subissent une phase d'expansion clonale qui conduit à la génération du nombre requis de neurones d'un type donné. Lorsque les neurones sont générés en nombre suffisant, ils entrent en état post-mitotique, migrent vers leurs positions terminales et se différencient. Cette succession d'événements complexes doit être strictement régulée, car même de petites altérations peuvent induire de graves modifications du développement cérébral, entraînant par exemple microcéphalie ou cancer. Les ARN non codants représentent une classe de molécules très polyvalentes, idéalement adaptées au contrôle précis des processus cellulaires, comme cela est particulièrement nécessaire pendant la neurogenèse.
Dans ce projet, le groupe d'Harold Cremer à l'IBDM de Marseille collaborera avec l'équipe d'Annalisa Fico à Naples, pour étudier comment deux classes d'ARN non codants, les longs ARN non codants (lncRNAs) et les microARNs, interagissent dans le contrôle de la neurogenèse. En utilisant comme principal modèle expérimental la neurogenèse postnatale de la zone sous-ventriculaire chez la souris, nous étudierons deux systèmes de régulation spécifiques.
Premièrement, nous étudierons les interactions entre T-UCstem1, un nouveau lncRNA qui contient un élément de séquence ultra-conservé, et les microARN miR-9-3p et miR-9- 5p, deux régulateurs bien établis de la neurogenèse. Dans des travaux antérieurs, nous avons démontré que cette interaction est essentielle pour la prolifération correcte des progéniteurs, suggérant un rôle de compteur moléculaire pour la production de neurones.
Deuxièmement, nous étudierons le rôle du lncRNA Cyrano dans le contrôle de miR-7 et par subséquent de Pax6. Ici, nos données indiquent une fonction spécifique de cette interaction dans le contrôle de la production de neurones dopaminergiques.
Enfin, nous viserons à fournir une vision plus générale de la régulation basée sur les lncRNA/miRNA au cours de la neurogenèse. À cette fin, nous réaliserons un crible d'expression in vivo à haute résolution pour les deux composants et identifierons systématiquement les interactions potentielles entre les T-UCE et les microARN.