Identification de facteurs de l'hôte favorisant l'inteaction entre les Enterobactéries et les cellules épithéliales intestinales chez les patients atteints de maladie de Crohn – HDACrohn

Une prévalence élevée de souches d'Escherichia coli invasives, nommées E. coli adhérent et invasif (AIEC), a été fréquemment observée chez les patients atteints de la maladie de Crohn. Limiter la colonisation intestinale par les AIEC pourrait être une stratégie thérapeutique intéressante pour prévenir la rechute chez les patients. Basée sur de solides résultats préliminaires, notre hypothèse est que l'expression / l'activité dérégulée des histones désacétylases (HDACs) dans les cellules épithéliales intestinales des patients atteints de MC, induite par des facteurs environnementaux tels que le régime alimentaire de type occidental, conduit à une modification de l'expression génique facilitant la colonisation des entérobactéries. L'objectif principal de cette étude est de mettre en évidence les mécanismes moléculaires conduisant à la colonisation intestinale par les AIEC chez les patients atteints de MC afin de proposer de nouvelles cibles thérapeutiques pour prévenir l’implantation de ces bactéries pathobiontes. Pour atteindre cet objectif, nous envisageons (1) d’étudier le rôle de HDAC1 et HDAC5 dans le contrôle de la colonisation intestinale par les bactéries AIEC et dans la réponse inflammatoire, (2) d’identifier les gènes régulés par HDAC1 et HDAC5 impliqués dans le processus d'invasion des AIEC, et (3) d'identifier les mécanismes moléculaires favorisant la colonisation de la muqueuse intestinale par AIEC chez des animaux nourris avec un régime occidental en focalisant l’étude sur le rôle de l'HDAC. Ce travail sera réalisé dans des modèles cellulaires et des modèles in vivo génétiquement modifiés. De plus, les résultats obtenus seront validés sur une cohorte de 180 patients déjà établie et pour lesquels les données de transcriptomique et de colonisation intestinale par les entérobactéries/AIEC sont disponibles.
L'identification de facteurs de l’hôte favorisant les entérobactéries et plus particulièrement les bactéries AIEC chez les patients devrait conduire à proposer de nouvelles stratégies alternatives pour prévenir la colonisation intestinale.