Exploration du lien entre structure-composition-fonction au sein du génome compartimenté de Streptomyces – STREPTOMICS

Les Streptomyces sont des producteurs de composés bioactifs intéressant en médecine et agriculture. Ces bactéries possèdent un grand génome linéaire compartimenté d’un point de vue génétique : sa partie centrale est riche en gènes conservés, et ses extrémités contiennent des gènes peu conservés, dirigeant la biosynthèse de métabolites spécialisés dont des antibiotiques. Les hypothèses de recherche de STREPTOMICS reposent sur un faisceau de résultats reliant la structuration 3D du génome, la fréquence de recombinaison et le contrôle global de l’expression génique. Les expertises complémentaires (génomique, génétique, bioinformatique, analyses biochimiques) des partenaires permettent de proposer un projet intégré dont le but est d’explorer le lien entre i) l’organisation 3D du génome en « domaines » et « compartiments », ii) la composition protéique de la chromatine, et iii) des processus moléculaires clés (transcription, recombinaison, ségrégation) de la dynamique du génome.