COVID-19 - Coronavirus disease 2019 2020

Plateforme de simulation pour l’évaluation et l’amélioration des mesures de lutte contre la diffusion du SARS-CoV-2 dans les EHPADs et les unités de soins de longue durée – COVEHPAD

Résumé de soumission

Contexte général : L’épidémie de COVID-19 actuelle pourrait être dévastatrice chez les personnes résident dans un établissement d’hébergement pour personnes âgées dépendantes (EHPAD) ou dans une unité de soins de long durée (USLD) compte tenu de l’intensité des contacts (entre les résidents et le personnel et entre les résidents), et de la difficulté du diagnostic due à une symptomatologie souvent trompeuse. Les recommandations données à la population générale pourraient ne pas être adaptées dans ce contexte spécifique. Décrire la diffusion de l’épidémie dans cette population fragile et quantifier l’impact des mesures de contrôle et de prévention mises en place est important pour apporter de l’information pouvant aider à adapter les recommandations pour la gestion de l’épidémie en cours et des futures épidémies dans ces établissements.
Objectif : L’objectif principal est de mettre en place une plateforme de simulation pour évaluer et améliorer les mesures de contrôle contre la diffusion du COVID-19 dans les EHPADs et les USLDs. Pour atteindre cet objectif, nous allons décrire la dynamique de diffusion de l’épidémie chez les personnes âgées en EHPADs ou USLDs, et quantifier l’impact des mesures de contrôle mises en place ou qui pourraient être proposées, en utilisant un modèle de simulation avec estimation des paramètres de transition.
Population étudiée : Il s’agira des résidents d’un échantillon de 20 établissements de la région Rhône Alpes Auvergne sélectionnés dans quatre strates : établissements publiques hospitaliers, publiques non hospitaliers, privés lucratifs, privés non lucratifs.
Données recueillies : Les données seront recueillies rétrospectivement à partir du 1er février 2020 et prospectivement jusqu’à la fin de l’épidémie. Elles comprendront en particulier le nombre journalier de cas possibles, probables et confirmés, leurs caractéristiques et leur évolution, le nombre et les caractéristiques des résidents, du personnel et des visiteurs, les mesures de contrôle et de prévention mises en place, le nombre de contacts entre le personnel et les résidents et entre les résidents mesurés par des capteurs électroniques dans un établissement.
Modélisation : La modélisation comprendra une étape d’estimation des paramètres basée sur les données observées et une étape de simulation pour quantifier l’impact de différents scénarios sur l’épidémie. Le modèle à compartiment mis en œuvre considérera 4 populations en interaction : les résidents, le personnel soignant, les médecins et les visiteurs, et les compartiments suivant : susceptible d’être infecté, infecté et en phase d’incubation, contagieux sans symptômes, contagieux avec symptômes, hospitalisé, guéri et décédé. Les résidents seront divisés en 3 groupes en fonction de leur niveau de dépendance mesuré par le score GIR. L’estimation des taux de transition et de l’effet des méthodes de prévention et de contrôle par décomposition de la vraisemblance, sera basée sur le nombre de transitions observées entre compartiments modélisé comme la réalisation d’un processus de Poisson. A l’étape de simulation, le modèle permettra de quantifier l’impact sur l’incidence de l’infection de modifications des taux de transitions dues à différentes mesures de prévention et de contrôle, de modifications de la matrice de contacts observés et de la prévalence de l’infection chez le personnel et les visiteurs.
Délivrables :
• Une plateforme de simulation comprenant le modèle développé et les paramètres pour diverses situations
• Les résultats de la modélisation
• Les recommandations pour améliorer la prise en charge des résidents

Coordination du projet

Philippe VANHEMS (Direction à la Recherche Clinique et à l'Innovation - Hospices Civils de Lyon)

L'auteur de ce résumé est le coordinateur du projet, qui est responsable du contenu de ce résumé. L'ANR décline par conséquent toute responsabilité quant à son contenu.

Partenariat

EPIMOD EPIMOD
EpiGreen EpiGreen
HCL - CHU LYON Direction à la Recherche Clinique et à l'Innovation - Hospices Civils de Lyon

Aide de l'ANR 94 370 euros
Début et durée du projet scientifique : mars 2020 - 18 Mois

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