Caractérisation des complexes de réplication associés à la membrane du SARS CoV 2 – CoMemRep

Comme d'autres virus à ARN à brin positif (+ ssRNAv), tels que le Flavivirus de la Dengue ou l’alphavirus du Chikungunya, le génome viral du SARS-CoV est synthétisé, coifée et polyadénylé par des complexes de réplication virales associés à des vésicules membranaires intracellulaires, appelées « usines virales ». L'objectif de CoMemRep est de découvrir et de fournir des informations structurelles à haute résolution sur les grandes machines de réplication du SRAS-CoV-2 associées à la membrane. Le projet est renforcé par des résultats révolutionnaires de l’équipe obtenus sur un virus apparenté : le virus Chikungunya. Les résultats fourniront une grande quantité de nouvelles cibles thérapeutiques pour les antiviraux ciblant l'association membranaire et l'oligomérisation des complexes de réplication, et changeront notre compréhension des mécanismes de la réplication du SARS et au-delà, conduisant à une amélioration des inhibiteurs actuels ciblés sur des complexes de réplication isolés ou partiels plutôt que sur « les usines virales » complètes. Ce projet est donc en phase avec l'appel à fournir de nouvelles cibles thérapeutiques contre la pandémie de Covid-19.
Le projet consistera en l'expression et la caractérisation structurale des protéines non structurales associées à la membrane (nsps), des machines de réplication du SARS-CoV-2 (nsp3-4 et 6) pour l'assemblage ultérieur des protéines impliquées dans la synthèse et le traitement de l'ARN (nsp7-16 ).