Etude sérologique du SARS-CoV-2 chez les donneurs de sang en Afrique subsaharienne : évaluation de la diffusion virale travers le Groupe de Recherches Transfusionnelles en Afrique Francophone. – AFRACOV2

Un nouveau coronavirus hautement pathogène, le SARS-CoV-2, diffuse actuellement au niveau mondial, depuis la Chine où il a émergé en décembre 2019, et est responsable à ce jour d’une pandémie sans précédent. Mi-octobre 2020, presque tous les pays ont déclaré des cas de COVID, la pathologie associée à ce nouvel agent infectieux anthropozoonotique, et plus de 38 million d'individus ont été confirmés/fortement suspectés positifs, avec un taux brut de létalité de 2.8 %. Au 20 octobre 2020, les données disponibles pour le continent africain faisaient état d’1,6 million de cas déclarés et près de 40 000 décès, soit un taux de létalité de 2,5 %.
A travers le projet AFRACOV-2, le CNR Risques Infectieux Transfusionnels (CNR RIT, INTS, France) propose d'évaluer la diffusion du SARS-CoV-2 en Afrique sub-saharienne, par une étude de séroprévalence chez les donneurs de sang de six pays du Groupe de recherches transfusionnelles d'Afrique Francophone (Burkina-Faso, Cameroun, Madagascar, Mali, Niger et République Centrafricaine). Deux groupes d’échantillons seront inclus dans l'étude : (1) 1000 échantillons provenant de donneurs de sang prélevés avant la pandémie en 2011-2012 dans quatre pays (Cameroun, Madagascar, Mali et Niger) issus d’une bio-collection de 16 500 échantillons détenue au CNR RIT et (2) une bio-collection de 6300 échantillons, établie dans le cadre du présent projet constituée du plasma résiduel provenant de la qualification biologique des dons (screening des agents pathogènes, détermination des groupes sanguins…).
Ont été, ou seront archivés, les 350 premiers dons de sang collectés sur trois périodes (avril/mai, juillet/août, octobre/novembre) dans les six pays d'Afrique francophone participants (1050 échantillons/pays), ainsi que les données suivantes, avant anonymisation totale : date du don, sexe, âge, domiciliation (zone urbaine ou rurale), statut du donneur (primo-donneur/donneur régulier), type de don (bénévole/familial), groupe ABO. Sur chaque échantillon, les anticorps totaux anti-SARS-CoV-2 seront recherchés par un test ELISA (Platelia SARS-CoV-2 Total Ab, Biorad). Les données sérologiques seront redressées par rapport aux données démographiques, et mises en regard des contextes pré-pandémique et pandémique.