COALITION : CO-émergence des infections ALphavIrales; de l'échelle cellulaire aux populaTIONs humaines. – COALITION

Les alphavirus causent des pathologies aiguës et chroniques chez l'homme, incluant des formes persistantes et débilitantes dans le cas du virus Chikungunya (CHIKV) qui a récemment diffusé sur 4 continents et affecté des millions de personnes. En Amérique Latine, CHIKV co-circule avec des alphavirus autochtones antigèniquement proches, notamment Mayaro (MAYV) et Una (UNAV). Cette situation épidémiologique, couplée à la récente introduction de CHIKV constitue une configuration unique pour comprendre la diffusion et la pathogénicité des alphavirus avant que l'adaptation à des hôtes vertébrés et invertébrés ne complique les analyses génomiques et sérologiques. Récemment les protéines MXRA8 et FHL1 ont été identifiées comme des cofacteurs de l'entrée cellulaire et de la réplication de CHIKV. Toutefois, les relations immunitaires liant des alphavirus demeurent mal connues et sont nécessaires pour la mise en place de programmes vaccinaux. Le projet COALITION rassemble 2 investigateurs allemands et 2 français avec des positions et expertises uniques pour étudier l'immunité alphavirale et une expérience dans les domaines du diagnostic, des modèles animaux, de l'immunité cellulaire, des déterminants d'hôte, et accès à des collections uniques de matériels biologiques. COALITION étudiera l'interaction immunitaire des alphavirus et leur épidémiologie à un niveau sans précédent dans un projet unique et intégré, en travaillant à l'échelle cellulaire, des organismes et des populations. À l'échelle cellulaire, COALITION déchiffrera in vitro et ex vivo les caractéristiques des infections alphavirales monospécifiques et doubles, analysera l'état cellulaire et les réponses immunitaires innées intrinsèques aux cellules, approfondira l'identification des facteurs d'hôtes modulant l'infection à CHIKV, MAYV et UNAV et étudiera l'impact des anticorps homotypiques et hétérotypiques sur l'infection. Au niveau des organismes entiers, COALITION évaluera la facilitation immune chez des patients infectés de façon aiguë par le CHIKV et des patients contrôles, en analysant de manière exhaustive leur immunité alphavirale antérieure. Les modèles d'infection des macaques cynomolgus permettront d'étudier dans des conditions expérimentales contrôlées la facilitation et la protection liées à une immunité héterotypique pré-existante entre CHIKV, MAYV et UNAV. Au niveau des populations, l'immunité de groupe prévenant potentiellement la diffusion de CHIKV sera évaluée par des études de séroprévalence différentielle à l'échelle du continent, une modélisation géospatiale et des reconstructions phylogéographiques. Des algorithmes d'apprentissage automatique validés par des données sérologiques particulièrement robustes seront utilisés pour projeter la future propagation de MAYV et CHIKV en Amérique latine. Les résultats de COALITION amélioreront profondément la compréhension de la pathogenèse et de la diffusion épidémiologique des alphavirus et seront précieux pour la mise en place et la sécurité des futurs programmes de vaccination contre ces menaces émergentes pour la santé humaine.