Reconstruction de particule isolée en microscopie de fluorescence – SP-Fluo
Les progrès récents des méthodes de super-résolution ont amélioré de façon spectaculaire la résolution en microscopie de fluorescence. Il est désormais possible d’observer des structures de protéines dans des assemblages macromoléculaires auparavant observables uniquement en microscopie électronique. Ces avancées restent cependant limitées par l’anisotropie de résolution des microscopes optiques et par le marquage fluorescent incomplet des structures. Le projet SP-Fluo a pour but de surmonter ces limitations pour rendre possible et fiable l’utilisation de la microscopie de fluorescence en biologie structurelle. L’anisotropie de résolution et le marquage partiel sont des limitations physiques intrinsèques à l’imagerie de fluorescence. C’est pourquoi nous abordons le problème d’un point de vue computationnel. Notre approche consiste à développer des méthodes de reconstruction de particule isolée, qui combinent les observations d’un grand nombre de particules identiques et aléatoirement orientées, pour reconstruire un modèle unique de particule à haute résolution. Le projet SP-Fluo aborde les verrous méthodologiques de traitement d’images intervenant dans l’ensemble de la chaîne de traitement, tout en menant conjointement des travaux appliqués en biologie. Les algorithmes développés durant le projet seront distribués sous forme de logiciel public.
Coordination du projet
Denis Fortun (Laboratoire des sciences de l'Ingénieur, de l'Informatique et de l'Imagerie (UMR 7357))
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Partenariat
ICube_ UNISTRA Laboratoire des sciences de l'Ingénieur, de l'Informatique et de l'Imagerie (UMR 7357)
Aide de l'ANR 282 863 euros
Début et durée du projet scientifique :
- 48 Mois