Opérons comme base pour la Découverte d'Enzymes actives sur les carbohydrates – ODE

L'objectif de ce projet est d'accélérer la découverte de familles d'enzymes impliquées dans la dégradation des glycanes. La dégradation des glycanes est essentielle pour la nutrition animale, les interactions hôte-pathogène, la réutilisation de la biomasse, etc.. Cependant, la découverte d'une nouvelle famille d'enzymes est fortement limitée par la sélection et la caractérisation d'une cible par des groupes indépendants de recherche expérimental. Le projet présenté ici fournira une solution informatique à grande échelle, tirant parti des données et annotations accumulées dans les bases de données CAZy et PULDB pour appliquer des approches de génomique comparative. Guidés par le contexte génomique, les familles de protéines de fonction inconnue les plus susceptibles d'être des familles d’enzymes actives sur les glycanes seront identifiées et leur catégorie de substrat sera prédite. Pour valider notre concept, des caractérisations expérimentales seront menées sur des cas sélectionnés.