Déchiffrer les conséquences biologiques et pathogéniques liées à un changement majeur de mode de vie – LifeChange

Le projet LifeChange développera une ligne de recherche originale visant à révéler les conséquences biologiques des changements sociétaux qui ont accompagné la colonisation de la Yakoutie par les Russes au cours du 17ème siècle. Ce projet évaluera également en quoi le changement majeur de mode de vie qui suivi conditionne encore l’état de santé actuel des populations actuelles de Yakoutie. L’histoire récente des Yakoutes nous donne ainsi l’occasion d’étudier les conséquences biologiques, médicales et sociétales du contact entre populations aux modes de vie traditionnels et modernes, au coeur de l’environnement le plus froid de l’hémisphère nord. Les colons Russes y ont en effet introduit les céréales pour la première fois, entrainant un profond impact sur le régime alimentaire Yakoute, traditionnellement basé sur la consommation de viande. Les colons Russes ont également introduit des pathogènes inconnus dans la région, comme la variole et la tuberculose, déclenchant dans les populations autochtones jamais exposées aux germes et donc immunologiquement naïves, de terribles épidémies. L’impact de l’expansion Russe ne s’est pas limité à la sphère biologique et médicale, mais a également retenti sur la sphère sociale, avec des populations devenant progressivement sédentaires et se convertissant au Christianisme. Les cinq derniers siècles de l’histoire Yakoute constituent donc un paradigme par lequel (1) les conséquences biologiques de la transition d’un mode de vie traditionnel vers un mode de vie moderne peuvent être étudiées in situ, mais aussi par lequel (2) il est possible de collecter des informations précieuses sur les pathogènes responsables des épidémies historiques, et identifier les raisons génétiques de leur virulence. Notre méthodologie s’appuiera sur des approches de pointe dans les domaines complémentaires de l’ADN ancien, la (méta) (épi) génomique, l’immunogénétique et la sociologie pour suivre l’établissement des changements introduits dans le génome, l’épigénome et le microbiome oral des Yakoutes suite à leur colonisation par les Russes. Un tel effort transdisciplinaire, alliant données biologiques et sociales, mais aussi données diachroniques et synchroniques, n’a jamais été entrepris auparavant. Cela nous donnera l’occasion de comprendre et de mesurer l’impact d’un processus de colonisation, qui s’est accompagné de profonds remaniements de l’organisation sociale et des modes de vie. En parallèle, nous évaluerons aussi comment l’organisation sociale et les contacts avec les animaux sauvages et domestiques, via la chasse et le pastoralisme, influent sur les profils épigénétiques, les microbiomes oraux et les risques de zoonoses parmi les populations actuelles. Ce projet apportera donc un premier test empirique essentiel pour tester des hypothèses médicales fondamentales, comme « l’hypothèse d’hygiène » et celle des « vieux amis », qui trouvent en nos modes de vie modernes, auxquels nous serions mal adaptés, une des raisons centrales de la recrudescence de maladies chroniques dans nos sociétés. Enfin, ce projet propose et incarne un nouveau paradigme pour l’étude des conséquences biologiques de la colonisation par les Européens, unifiant données archéologiques, historiques, ethnologiques, médicales et biologiques au sein d’un même et unique cadre de travail cohérent.