Facteurs Environnementaux, Génétiques et Epigénétiques prédisposant à l’hypospadias et la cryptorchidie communs – HYPOCRYPT-ENVIROGENEPIG

L'hypospadias (H, malformation du méat) et la cryptorchidie (C, non descente des testicules) sont les malformations congénitales les plus fréquentes, respectivement 1/300 et 3-6% des garçons à la naissance. Dans moins de 5% des cas, un diagnostic de maladie endocrinienne génétique explique la malformation. Mais dans 95 % des cas, H et C restent sans aucune cause décelable : ces formes « communes » sont dénommées cH et cC. Ce sont elles qui constituent la cible de notre projet. Nous nous proposons d’entamer la recherche de leurs facteurs prédisposants, qui sont multifactoriels :
1) Des facteurs génétiques (G) seront cherchés par des analyses « génome entier » d’association (GWAS) conduites au CNG et financées par le GIS-IBiSA, notre projet ayant été retenu en 2009.
2) Des facteurs épigénétiques (epiG) seront recherchés au niveau de la méthylation de l’ADN des lymphocytes, en cherchant des associations entre niveau de méthylation globale ou site-spécifique et les malformations étudiées.
3) L’environnement sera abordé dans des comparaisons cas-contrôles selon trois méthodes « globales » : a) analyse de profils de spectrométrie de masse sérums et urines ; b) analyse du biotope à partir des adresses familiales (géocodage) et de bases de données françaises géographiques ; c) analyse de l’histoire maternelle par des questionnaires multi-items non orientés. Ces approches, leurs apports nouveaux, et leurs limites, sont discutés dans le projet. Elles constituent un des éléments les plus innovants de notre recherche.
4) Une autre composante innovante du projet est le choix que nous avons fait de méthodes dites de « data-mining » appuyées sur des techniques de « machine learning ». Ces techniques seront utilisées : a) pour l’analyse de l’environnement ; b°et pour l’analyse intégrée conjointe des facteurs génétiques, épigénétiques, environnementaux, en collaboration avec une société innovante d’analyse mathématique « haut débit ».
Enfin, notre étude de la causalité cH et cC pourrait ouvrir une porte vers le « Syndrome de Dysgénésie Testiculaire » (hypofertilité, cancers des testicules) dont le risque augmente en Europe.

Notre espoir est que les résultats de notre étude pourraient se prolonger vers des stratégies de prévention si certains des facteurs de risque environnemental, maternel par exemple étaient évitables.