Algorithmes de Graphes et Plateforme Logicielle pour la Modélisation Interactive des Structures d'ARN – AMIS ARN

Le but du projet est d'effectuer des avancées significatives dans la problématique de la prédiction (ou modélisation) in silico de la structure tridimensionnelle des molécules d'ARN à partir de leurs séquences. Ce projet pluridisciplinaire comprend trois volets principaux : développement et étude (théorique et expérimentale) de nouveaux algorithmes de graphes pour résoudre des points-clés de la modélisation des structures d'ARN ; implémentation de ces algorithmes dans une plateforme logicielle originale qui sera mise à disposition de la communauté scientifique ; application des méthodes développées pour la modélisation de molécules d'intérêt. Le projet repose sur une collaboration étroite entre trois équipes complémentaires composées de spécialistes de bioinformatique, d'algorithmique des graphes, de biochimie et de modélisation de l'ARN. Ces compétences réunies permettront de développer des approches conceptuelles nouvelles, fondées du point de vue théorique et opérationnelles du point de vue des applications biologiques. La plateforme logicielle développée aura vocation à devenir un standard pour la bioinformatique structurale.