– BRASERO

Depuis quelques années, le rôle des ARN non-codants dans les différents processus cellulaires a été considérablement réévalué. On sait maintenant que de petits ARN non codants (tels que les petits ARN nucléaires, les petits ARN nucléolaires, les micro-ARN) interviennent à tous différents niveaux de la régulation et de l'expression des gènes, par exemple. Il y a donc un besoin crucial d'outils informatiques pour aider à la manipulation et à la modélisation des ARN. Le but de ce projet est de fournir des outils à la fois efficaces et pertinents d'un point de vue biologique pour le problème essentiel de la comparaison d'ARN. Le projet inclut trois volets originaux: la conception de modèles combinatoires et d'algorithmes efficaces (issus de théorie des graphes et des arbres), la constitution de données de benchmarks pour l'évaluation et la validation sur des réelles problématiques biologiques, le développement de logiciels librement diffusés intégrant également des programmes originaux visualisation. Ces travaux devraient mener à la proposition d'outils standard qui ont vocation à devenir une référence dans la communauté. Le projet repose sur une collaboration étroite entre quatre équipes multidisciplinaires qui ont une longue expérience de l'algorithmique et de la biologie de l'ARN.