Projet Bioscope "l'observatoire du vivant en Méditerranée" – ANR-05-SEST-0048

L'objectif général est, en s’adossant sur le dispositif en cours de déploiement en Corse et sur la Méditerranée d’une surveillance sentinelle chez l’homme, de renforcer les aspects d'observation et de recherche en épidémiologie théorique sur le vivant intégrant ses composantes humaines et animales et concernant les pathologies infectieuses émergentes, en incluant une référence forte en virologie et microbiologie. * L’« observation de la santé chez l’homme ». L’U707 de l’Inserm coordonne cette partie du projet qui vise à la mise en place d’un système d’observation de type Sentinelles en Corse, assurant une surveillance permanente et continue d’indicateurs de santé (notamment la grippe, gastroentérites, maladies à prévention vaccinale) s’inscrivant dans la perspective de veille sanitaire coordonnée par l’InVS et la Cire Corse-PACA, en collaboration avec les acteurs des départements concernés ; le système reposant principalement sur un réseau de médecins généralistes sentinelles produira une analyse en temps-réel contribuant à l’alerte précoce et fournissant des prévisions épidémiologiques fiables sur le territoire corse, par une redistribution immédiate de l’information à destination des autorités de santé, des professionnels de santé, et du grand public. * L’« observation de la santé animale ». Les unités Epidémiologie Animale (INRA Theix) et Gestion de la santé animale (UMR, Nantes) coordonnent le volet d’épidémiologie animale avec les différents acteurs impliqués, l'Unité Epidémiologie AFSSA, l'UMR, le CIRAD et l'UMR Virologie (AFSSA-Inra-ENVA). Il est envisagé dans un premier temps de s'appuyer sur deux entités pathologiques déjà étudiées en Corse, la trichinellose et la Blue tongue. Ce programme viendra compléter les projets déjà engagés sur ces deux entités, sur l'aspect « surveillance – sentinelle », en collaboration avec la partie humaine, incluant une phase de faisabilité visant à étendre la surveillance à d'autres maladies / agents pathogènes. * Les recherches en épidémiologie théorique des maladies émergentes : associant des équipes de l’Inra, de l’Inserm, l’IRD, universités, de l’ENS et du Cirad. L’observation couplée de la santé humaine, la santé animale et les indicateurs environnementaux disponibles (climatiques notamment) permettront la confrontation aux données de modèles d’épidémiologie évolutive pour mieux comprendre les conditions et la dynamique de diffusion de microorganismes en population, et mieux définir quels outils pourraient nous permettre de caractériser les conditions d’émergence. Les données épidémiologiques provenant d’élevages avicoles, de faune sauvage, de population porcine, de population humaine à risque, notamment en termes de taux de contact et de prévalence permettront de récréer un écosystème qui servirait de base à l’implémentation de modèles mathématiques de type SIR individus-centrés, à des analyses spatio-temporelles et à l'analyse d'évènements rares. * Les aspects financiers recouvrent 1140 Keuro demandés sur trois ans pour initier ce projet, répartis à part égale entre les volets « santé humaine » et « santé animale ». Il permettra de financer aussi une plate forme lourde de collecte et d’analyses de données épidémiologiques, entomologiques, ornithologiques, et virologique utiles aux projets en cours, notamment sur la Blue tongue, la trichinellose, la grippe aviaire, et la grippe chez l’homme.Ce budget permettra aussi le recrutement d’un ingénieur basé en Corse, chargé de coordonner les travaux localement, et d’animer et développer progressivement le réseau d'acteurs de terrain pour l'aspect sentinelle-animal.