Pathocénose et émergence des maladies transmissibles : un concept unificateur mis à l'épreuve sur des pathologies exemplaires – ANR-05-SEST-0013

L’émergence de maladies infectieuses est un problème de santé publique d’une acuité croissante, qui touche tant les pays en développement, émergents ou industrialisés. Des facteurs, souvent d’origine anthropique, sont connus pour favoriser l’émergence d’infections principalement via les modifications environnementales qu’ils impliquent. Toutefois, l’appréhension du lien entre ces facteurs et le risque d’apparition d’une nouvelle pathologie se limite le plus souvent à la simple corrélation, sans compréhension du mécanisme précis, i.e. la cascade de conséquences affectant la dynamique du système hôte-parasite, qui mène de ce facteur environnemental à l’émergence. Sans l’identification de ces mécanismes fins, il est difficile de mettre en place des plans d’alerte et de contrôle qui permettent d’agir efficacement sur le risque d’émergence des maladies. Notre objectif consiste à connaître les facteurs de risque mis en cause et comment ils conduisent 1) soit à l’apparition d’une forme plus (ou moins) sévère d’une pathologie préexistante, 2) soit à l’apparition d’une maladie nouvelle chez l’Homme du fait d’une contamination par un pathogène strictement animal jusqu’alors. Dans ce cadre nous proposons de rompre avec l’approche verticale isolant le système microparasite-espèce(s) réservoir(s)/vectrice(s)-Homme, pour considérer, au contraire, l’émergence d’une pathologie comme l’altération d’un état d’équilibre préexistant entre les pathogènes qui circulent dans une population donnée, à un instant donné, sur un territoire connu. Le concept de pathocénose fournit un cadre adapté à cet objectif. Ce concept permet de faire le lien entre l’ensemble des pathogènes présents au sein d’une population d’hôtes, à la fois entre eux et en interaction avec leur environnement éco-épidémiologique. La pathocénose implique que la distribution de chaque maladie doit être considérée avec les autres pathologies présentes au même moment. Dans une situation écologique stable, elle tend vers un équilibre caractérisé par l’ensemble des maladies observées. Réciproquement, une perturbation des conditions environnementales peut entraîner une altération de la pathocénose, éventuellement à travers ses interactions avec les pathocénoses d’autres espèces et mener à l’émergence d’une pathologie inédite. Le cadre de pathocénose unifie l’ensemble des mécanismes d’émergence et autorise une étude synthétique du rôle des facteurs impliqués dans l’émergence. Afin d’aborder la diversité des facteurs de risque et des mécanismes, nous basons notre démarche sur une approche comparative de systèmes contrastés. Le mécanisme appréhendé, nous pourrons circonscrire les situations à risque et définir des plans d’action contre les effets des pathogènes (ce qui n’implique pas forcément la lutte contre le pathogène lui-même). La modélisation mathématique associée au recueil des données constituera le fil directeur transversal à l’ensemble des systèmes étudiés. L’association de chercheurs de disciplines variées est un atout majeur pour formaliser le questionnement de l’émergence dans le cadre plus large de la pathocénose.