Confinement et exaltation électromagnétique pour biopuces – Coexus

Notre projet vise à atteindre, dans un contexte industriel, la détection par marquage fluorescent de multiples molécules uniques, sur format puce à ADN, en détection hautement parallèle. Il exploite les effets de confinement et d’exaltation des ouvertures nanométriques mis à jour dans le projet Nanospot (ACI 2003) combiné au savoir faire de la jeune pousse GENEWAVE sur l’exaltation de la fluorescence dans le contexte des biopuces. Outre les aspects de nanophotonique liés à la conception et à la réalisation des ouvertures, nous prenons en compte les spécificités de l’hybridation sur puce (‘spotting’ des sondes, fluidique et transports) pour la définition des ouvertures (nombre, taille, espacement). On explorera aussi dans quelles conditions on peut étendre la détection d’hybridation au cas où il n’y a pas de marquage fluorescent. On utilisera pour cela un contraste non linéaire de type Raman stimulé, dans un contexte de puce protéique où les signatures vibrationnelles et leur exaltation prennent toutes leur importance. Le point commun avec la fluorescence est l’exaltation optique qui demande une ingénierie des nano-ouvertures optiques similaires. Deux partenaires académiques , l’Institut Fresnel (IF-Marseille) et l’Institut de Science et d'Ingénierie Supramoléculaires (ISIS-Strasbourg), s’associent avec l’entreprise GENEWAVE (Palaiseau) spécialisée dans la réalisation et la commercialisation de biopuces (‘Micro-Array’) pour la génomique capable d’exalter le signal de fluorescence. La combinaison des connaissances portant sur l’ensemble des étapes d’une puce d’une part et sur la nanophotonique des ouvertures nanométriques d’autre part constitue l’atout majeur de ce projet.