Projets financés
Reconnaissance de pli et repliement inverse: vers une prédiction à grande échelle des structures de protéines – PROTEUS
La séquence d'acides aminés d'une protéine détermine sa structure 3D et, à travers celle-ci, sa fonction biologique. Si les projets de séquençage de génomes ont élucidé des millions de séquences protéiques, seules ~30.000 structures 3D sont connues. Des méthodes de modélisation « par homologie » pré
Performances previsibles et sécurité des communications dans un contexte de clusters virtuels dynamiques. Application aux domaines biomédical et bio-informatique. – HIPCAL
HIPCAL étudie un nouveau paradigme de contrôle des ressources d’une grille basé le concept de clusters virtuels confinés. Cette approche vise à apporter des solutions en termes de portabilité, de prédiction de performance et de sécurité aux applications de calcul intensif issues des domaines de la b
– THALER
Le projet a pour objectif de développer une plateforme de simulation moléculaire pour le calcul de haute performance sur les architectures massivement parallèles. Un aspect particulier est la création d'une bibliothèque pour les opérations numériquement intensifs qui, grâce à une interface standardi
– ASTER
Les instabilités Magnéto-Hydro-Dynamique, appelées Edge Localized Mode (ELM), sont régulièrement observées dans les scenarios standard des plasmas sur un tokamak. Les pertes d'énergie induites par ces ELMs dans les plasmas du réacteur ITER sont un réel problème. De plus, la compréhension actuelle de
Simulation Numérique pour la Recherche en Rayonnement, Gravitation et Hydrodynamique . – SINE
Ce projet vise à satisfaire les besoins communs, en matière de simulation numérique, des communautés scientifiques de l’Astrophysique et de la Fusion Inertielle par Laser. En effet, l’activité de recherche de ces communautés repose très largement sur la simulation numérique d’écoulements complexes,
Parallélisation Incluant le Temps pour Accélérer les Calculs – PITAC
Les architectures parallèles annoncées (la plus importante, au Laboratoire national de Oak Ridge du département américain de l’énergie, étant proposée par Cray, elle sera constituée de 24 000 quadripro), les machines Blue Genes qui sont réparties un peu partout sur la planète (la plus grosse ayant p
– HOUPIC
Les codes PIC (Particle-In-Cell) sont devenus un outil essentiel pour la simulation de nombreux phénomènes physiques mettant en jeu des particules chargées, comme en physique des accélérateurs et des plasmas incluant les plasmas de fusion. Les phénomènes réellement cinétiques peuvent être modélisés
Simulation efficace d'examens précliniques et cliniques en tomographie d'émission – FGATE
Le projet fGATE vise à contribuer significativement au développement de la simulation numérique et à promouvoir son utilisation en imagerie fonctionnelle et moléculaire in vivo par tomographie d’émission, en rendant possible la simulation d’examens cliniques ou précliniques très réalistes, incluant
