Projets financés
Régulation de la mort cellulaire végétale par la voie de signalisation MAPK-IPS1 – MAPK
Comprendre comment les plantes induisent la mort cellulaire est important pour comprendre qu’est ce qui se passe apres une attaque par des pathogenes mais egalement quand chaque automn des tonnes des feuilles meurent et sont sacrifiees par des plantes vivaces. L’identification des regulateurs majeur
Rôle du transportome aux interfaces biotrophes des interactions mutualistes plantes-champignons. – TRANSMUT
La compréhension des mécanismes permettant une utilisation efficace de l’azote, du phosphate et du potassium par les plantes mycorhizées et ceux contrôlant l’allocation des composés carbonés est cruciale pour un management raisonnée de la forêt et des cultures. En effet, ces mécanismes conditionnen
Analyse à grande échelle du positionnement des nucléosomes dans les noyaux de Paramecium tetraurelia – GENOMAC
Dans les noyaux des cellules, l’ADN est enroulé autour de complexes protéiques pour former les unités primaires de la chromatine appelées nucléosomes. De nombreuses études montrent que cet empaquetage ne se fait pas au hasard et que le positionnement des nucléosomes joue un rôle important, notamment
Exploration Globale des interactions ARN-ARN chez les bactéries – Duplex-Omics
Contrairement à l’action des microARN eucaryotes, celle des ARN régulateurs bactériens (aussi appelés small RNA - sRNA) a été très peu étudiée en termes de conservation, de contraintes de reconnaissance ou de thermodynamique. Le jeu d’interactions sRNA-cible réellement démontrées reste extrêmement r
Spectrométrie de masse et analyses fonctionnelles pour une étude globale de la phosphorylation du canal calcique de type T, Cav3.2 – Phospho-Cav
L’objectif de Phospho-Cav est l’étude de la phosphorylation des canaux calciques de type T. S’il est aujourd’hui reconnu que ces canaux T sont régulés fonctionnellement par des sérine/thréonine kinases, les modalités de cette régulation sont encore inconnues. Le challenge relevé par le projet Phosph
Fonction des glutarédoxines dans la signalisation redox et le « sensing » du fer chez les plantes – FIRES
Les protéines contenant du fer sont essentielles pour de nombreuses voies métaboliques ou processus cellulaires (photosynthèse ou respiration). Toutefois, les mécanismes de régulation de l’homéostasie du fer et le fonctionnement des machineries d’assemblage des protéines fer-soufre (Fe-S) chez les p
Programme spatiotemporel de réplication du génome humain – REFOPOL
Ce paragraphe précise les enjeux et objectifs du projet : indiquez le contexte, l’objectif général, les problèmes traités, les solutions recherchées, les perspectives et les retombées au niveau technique ou/et sociétal La duplication ou réplication de l'ADN est un processus fondamental de tout êt
Du réseau de gènes à la forme des organes : une étude interdisciplinaire du développement foliaire. – MorphoLeaf
La marge des feuilles peut être plus ou moins découpée, dépourvue d’incision, avec des incisions modérées (dentée), ou prononcées (lobée). La feuille elle-même pouvant être simple ou découpées en unités appelées folioles. Nous avons identifié un facteur génétique conservé, les gènes CUC, qui sont né
Identification de Nouveaux Régulateurs de la Voie NF-kB par Crible Génétique à l’Echelle Génomique – kB-Regs
Il est proposé ici d'identifier de nouveaux régulateurs (positifs ou négatifs) de la voie NF-?B. Plus particulièrement nous rechercherons ceux qui sont impliqués dans la réponse immunitaire innée qui combat l'infection, ceux qui participent à la réponse aux agents chimiothérapeutique, atténuée par l
Approche fonctionnelle intégrée des protéomes S-Palmitoylés et N-Myristoylés chez Arabidopsis – PalMyProt
Ce projet se propose d’investiguer l’espace et la fonction de deux modifications lipidiques majeures affectant les N-termini des protéines, la N-Myristoylation (MYR) et la S-palmitoylation (PAL) en intégrant deux double-niveaux d’analyse (i) un niveau descriptif global au niveau du protéome et un ni
Régulation de la dynamique du protéome chloroplastique – Chloro-Pro
Dans le cadre d'un projet collaboratif (ANR Génoplante 2006; projet “GlycoChloroplast”) réalisé entre nos deux laboratoires (LPCV et EDyP), nous avons produit des outils importants pour analyser la dynamique du protéome du chloroplaste à l'échelle d'un organite entier. L'un de ces outils, encore uni
Réplication et instabilité des sites fragiles communs – repinsCFS
Un certain nombre d'arguments suggéraient que la façon dont se duplique l'ADN au niveau de ces sites fragiles au cours de la division de la cellule (la réplication) pourrait présenter des particularités qui expliqueraient leur fragilité. Nous avons donc étudié en détail la réplication de l'ADN au ni
Mono ou poly ovulation, rôle évolutif du gène BMP15 chez les mammifères – MONOPOLY
Parmi les mammifères, il existe une forte variation du nombre d'ovulations dans les ovaires à chaque cycle sexuel et donc du nombre de nouveau-nés à chaque naissance. En effet, le nombre de petits peut aller de 1 à 2 chez la femme, la vache ou la brebis, à plus de 10 petits chez les rongeurs ou la t
Implication de la structure chromatinienne lors de la réparation de l’ADN – ChromaRep
x x x x L'intégrité de notre génome est constamment remise en cause par divers agents endommageant l’ADN. Ces dommages peuvent survenir suite à une exposition à des agents exogènes environnementaux tels que la lumière UV ou des irradiations, ou à des agents endogènes, tels que les radicaux libres ox
Déchiffrer la biologie des génomes grâce à une combinaison unique de Génomique comparative, Génomique fonctionnelle et Génomique populationnelle (3G) – GB-3G
La recherche fondamentale en biologie s’est développée autour d’organismes modèles représentant seulement quelques unes des innombrables espèces vivantes. Pour la plupart, ces organismes modèles sont évolutivement très éloignés les uns des autres et cette distance ne permet pas d’aborder de manière
Application du PICh à la caractérisation du régulome de la transcription par l’ARN Polymérase III – PIChClassIII
Il semble bien établi maintenant que la régulation de la transcription par l’ARN polymérase III joue un rôle majeur sur l’adaptation des cellules aux changements physiologiques ou aux variations de leur environnement, notamment lorsqu’elles sont soumises à des stress. Nous cherchons à décrypter les
Analyse globale de la régulation des ARN contenant des PTC par la voie du NMD et le complexe EJC-like chez des levures riches ou pauvres en introns – YeastIntrons
Le rôle des introns et de la régulation de leur épissage ont été principalement étudiés chez les métazoaires avec les limitations techniques attenantes à l’étude des ces organismes. Nous étudions l’épissage des introns chez les champignons pour lesquels cette thématique de recherche a été de façon s
Déchiffrage du réseau de signalisation dépendant des béta-arrestines induit par les récepteurs couplés aux protéines G. – GPCRnet
Les récepteurs couplés aux protéines G (GPCR) sont impliqués dans la majorité des processus physiologiques et pathologiques. De plus, ils sont la cible de près de 50% des médicaments actuels. L’objectif de GPCRnet est de mieux comprendre les mécanismes qui relaient le flux d’information depuis les G
Développement d'outils de génomique fonctionnelle chez le nématode C. elegans. – Elegineer
Le nématode C. elegans est un système puissant et apprécié pour analyser des mécanismes biologiques fondamentaux pertinents pour la recherche biomédicale. C. elegans a été déterminant pour identifier les gènes centraux de la machinerie de l'apoptose et pour caractériser le phénomène d'ARN interfére
Formation, dynamique et fonctions épigénétiques des résidus 5-hydroxyméthylcytosine dans l'ADN. – EPIGENOME
Ce projet vise à étudier la fonction des 5-hydroxyméthylcytosines (5hmC) dans les changements épigénétiques et l’instabilité génétique. Nos objectifs seront structurés en 4 tâches : i) Rôle des protéines TET2, du stress oxydatif et des enzymes impliquées dans la réparation de l’ADN sur la formation