Phénotypage Animal pour la Transition Agroécologique des Systèmes d'Elevage

Le projet PATASEL (Phénotypage Animal pour la Transition Agroécologique des Systèmes d’Elevage) est porté par l'infrastructure de recherche (IR) LiPH4SAS (www.liph4sas.fr). LIPH4SAS est une IR distribuée, qui permet également de tirer parti de ressources génétiques, d’environnements et de systèmes d’élevage diversifiés (plaine vs moyenne montagne, système conventionnel vs bio). Elle permet à la fois une exploration fonctionnelle multi- échelle et des mesures, à l'échelle de l'animal, sur de grands lots d'animaux (phénotypage horizontal) au statut sanitaire contrôlé et situés dans des environnements maîtrisés et caractérisés.

Le premier objectif du projet PATASEL est de doter LIPH4SAS d’équipements de phénotypage animal performants. L’essentiel des équipements prévus dans le cadre du projet a été acquis dès 2024, permettant le bon déroulement des projets de recherche associés (projets WAIT4, HOLOBIONTS, COBREEDING, AGRODIV notamment). Ils concernent notamment la mesure caractères clés pour la transition agroécologique et l’adaptation au changement climatique (ingestion d’aliments concentrés, de fourrages et d’eau, gaz à effets de serre, comportements  , indicateurs de bien-être et santé, paramètres d’environnement). Le second objectif de PATASEL est d’assurer la FAIRisation des données produites, leur interopérabilité avec les données produites via d’autres infrastructures (RARe, France Génomique) et leur mise à disposition des communautés scientifiques. Une première version de SPIDER, plateforme permettant l’accès à l’ensemble des données collectées sur chaque animal, est actuellement en cours de test.