Equipement national de transcriptomique spatio-temporelle à résolution cellulaire

Spatial-Cell-ID a pour ambition d’identifier et de caractériser les variations des réseaux génétiques de chaque cellule dans un organisme animal et végétal, qu’il soit adulte ou en cours de développement, sain ou malade en utilisant non seulement les dernières technologies de transcriptomique spatiale mais également en en développant de nouvelles. Un tel objectif ne peut être atteint qu’au moyen d’équipements de pointe, aussi bien pour la caractérisation de l’hétérogénéité cellulaire à haute résolution spatio-temporelle que pour l’analyse intégrée des données générées.

Nous sommes actuellement dans la phase de mise en place qui se caractérise dans un premier temps par l’achat d’équipements. Cette phase est particulièrement critique car les technologies de transcriptomiques spatiales évoluent très vites. Certains équipements et/ou technologies concourante n’ont pas pris le dessus les unes sur les autres. Pour diminuer les risques de mauvais choix technologiques Spatial-Cell-ID se base sur des techniques différentes et complémentaires prises en charges par trois groupes de travail appelés ‘groupe de travail d’acquisitions de données’. Ces groupes de travail regroupent divers membres de la communauté scientifique Lyonnaise ayant des expertises complémentaires. 

Pendant cette quatrième année nous avons poursuivi l'achat des équipements les plus adéquates à nos objectifs. Enfin l’Equipex Spatial-Cell-ID veut également développer ou améliorer les technologies existantes. Pour cette raison, les différents groupes de travail sont également en train de mettre en place ou de développer de nouveaux protocoles adaptés à divers échantillons.