Au plus profond des interactions Chien-Homme : Révéler les adaptations du chien au mode de vie agropastoral à travers la paléogénomique, la morphologie fonctionnelle et la géochimie – CROC

Depuis sa domestication par les chasseurs-cueilleurs il y a au moins 17 000 ans, le chien est le compagnon des humains, partageant
leur mode de vie et dépendant principalement de la nourriture issue des activités humaines. Les sociétés humaines ont connu une
révolution socio-culturelle majeure lors de la transition néolithique qui s'est traduite par l'adoption d'un mode de vie agropastoral. Cela
a entraîné un changement de régime alimentaire entraînant une augmentation de la consommation d'amidon et de glucides. Compte
tenu de la proximité entre les humains et les chiens et de leur mode de vie commun, nous nous attendons à ce que les chiens soient
impactés par cette transition alimentaire aux niveaux génétique, morphologique et fonctionnel, faisant d'eux, en retour, un marqueur
des changements culturels dans les sociétés humaines. Notre projet s'appuie sur une approche multidisciplinaire combinant
archéologie, isotopie, morphologie fonctionnelle, paléogénomique évolutive et métagénomique qui nous permettra a) de reconstruire
les niveaux trophiques et d'évaluer le régime alimentaire du chien via des analyses isotopiques basées sur le collagène osseux et les
acides aminés ; b) d’effectuer des analyses biomécaniques et morphométriques des mandibules et des éléments post-crâniens des
chiens ; c) effectuer une analyse métagénomique du microbiote oral canin ; et d) d’évaluer la diversité génomique des chiens anciens.
Tous les résultats seront interprétés dans leur contexte archéologique. A travers l'étude du régime alimentaire des chiens, le projet
CROC permettra d'analyser les interactions homme-chien et le rôle des chiens dans chaque société. Enfin, les adaptations résultant
de la modification du régime alimentaire suite à la transition néolithique permettront de déterminer comment ces changements
anthropiques ont façonné l'espèce la plus proche de l'homme et de préciser le degré d'évolution parallèle entre l'homme et le chien au
cours de ce profond changement.