Formulation d’un agent bactérien de biocontrôle pour lutter contre plusieurs pathogènes et maladies de la pomme de terre – SaveTuber

Contexte et objectifs : Le projet SaveTuber développera différentes formulations d’un nouvel agent de biocontrôle et évaluera leur efficacité pour lutter contre plusieurs pathogènes et maladies de la pomme de terre (PdT), une culture en situation d’usage orphelin et dont la filière française du plant de PdT est deuxième exportatrice mondiale. L’agent de biocontrôle Pseudomonas sp. PA14H7 cible les pathogènes Dickeya et Pectobacterium responsables de bactérioses (jambe noire et pourriture molle) dont les traitements (peu efficaces) sont à base de sulfates de cuivre. En 2021, ces agents pathogènes étaient responsables de 37% des refus lors du processus de certification des tubercules de semence produits en France. Pseudomonas sp. PA14H7 cible aussi d’autres pathogènes tels Rhizoctonia solani et Phytophtora infestans contre lesquels sont utilisés des produits phytopharmaceutiques. Les travaux antérieurs ont permis l’identification et la caractérisation de cibles de Pseudomonas PA14H7 (TRL1 à TRL3), la réalisation d’essais d’efficacité en serre (TRL4) et au champ (TRL5). L’objectif du projet SaveTuber est de franchir un verrou permettant une montée en TRL6 à TRL8 : il s’agit de la production à large échelle de l’agent biocontrôle et de sa formulation, deux étapes indispensables à des essais de qualification en condition réelle.
Approche et méthodologie : Le projet SaveTuber (36 mois) est découpé en 6 tâches: (1) la production et (2) la formulation de l’agent de biocontrôle seront pris en charge par YpHen, une entreprise spécialisée dans la formulation d’agents biologiques ; (3) le développement d’outils de suivi de l’agent biocontrôle in situ par le partenaire académique (I2BC), (4) des essais de protection en parcelles expérimentales (TRL6 à TRL7) puis (5) avec des producteurs volontaires (TRL8) seront coordonnés par le partenaire filière plants de PdT (FN3PT/inov3PT) et le partenaire académique (I2BC). Une dernière tâche (6) permettra de réaliser le bilan et de faire des choix de valorisation des produits. Ce projet mobilisera 16 personnes dont 1 ingénieur CDD-IE de 3 ans financé par l’ANR qui réalisera, notamment, le suivi moléculaire de l’agent biocontrôle et des pathogènes tout au long du projet (Tâches 3, 4 et 5).
Utilisateur final : Le premier utilisateur est le producteur de plants certifiés en France. En France, en 2021, les pertes causées par les pathogènes Dickeya et Pectobacterium ont été estimées à 6 M euros. Une réduction de ces pertes est attendue avec l’utilisation de l’agent de biocontrôle proposé. D’autres usages sont concernés par ces pathogènes et la solution proposée : betterave, carotte, endive, tomate.
Pertinence et durabilité de la solution : Le développement de cet agent de biocontrôle est conduit en synergie avec d’autres approches de lutte dont la prophylaxie et la création variétale. Ce nouvel usage représente un effort de transition Ecophyto important de la filière plants de PdT. Un gain est aussi attendu avec les autres cibles Rhizoctonia solani et Phytophtora infestans contre lesquels il existe des produits pharmaceutiques de lutte. Ces derniers représentent une part importante de l’indice IFT pour la culture PdT. Le projet SaveTuber évaluera la substitution totale ou partielle de ces produits en prenant comme modèle Rhizoctonia solani. Ainsi, ce projet contribuera à réduire l’impact environnemental global des itinéraires de production pour plusieurs pathogènes tout en augmentant la productivité de la filière.
Consortium : Le consortium associe la filière plant de PdT (Inov3PT de la FN3PT), un acteur académique (I2BC) ayant une expertise sur les interactions plantes-pathogènes et YpHen, une entreprise spécialisée dans la production et la formulation d’agents biologiques. Leurs expertises complémentaires permettront de franchir les étapes clés de production et l’évaluation d’un nouvel outil de protection des cultures de plants de PdT.