Caractérisation des rôles des lncRNA dans le développement et l'évolution des algues brunes – BrownLincs

Les algues brunes (Phaeophyceae), sont des macroalgues multicellulaires qui appartiennent au supergroupe eucaryote Stramenopile, qui comprend également des microalgues (i.e., les diatomées) ainsi que des protistes hétérotrophes (i.e., les oomycètes). Comme les plantes et les animaux, les algues brunes font partie du petit nombre de lignées qui ont acquis une multicellularité complexe. Pourtant, le processus évolutif menant à la multicellularité chez les algues brunes a été très distinct, conduisant à l'acquisition de certaines caractéristiques uniques, absentes chez les autres lignées. Ce projet vise à approfondir la compréhension des processus moléculaires qui régissent le développement des algues brunes et l'acquisition de la multicellularité par l’analyse fonctionnelle du rôle régulatoire des longs ARN non codants (lncRNAs), acteurs clés de la régulation cellulaire dans le domaine Eukarya. Par une approche multidisciplinaire, dont les trois partenaires ont des expertises démontrées, impliquant la génomique et trancriptomique comparatives, la biologie computationnelle, la biologie fonctionnelle et l'épigénomique, ce projet caractérisera la façon dont les lncRNAs contrôlent les programmes d'expression génétique qui définissent des états de développement chez les algues brunes. Ectocarpus sp. et Saccharina sp. seront les systèmes modèles de choix car ils présentent des morphologies de développement distinctes tout étant assez proches sur le plan évolutif. Au niveau fondamental, ce projet apportera de nouvelles connaissances sur la régulation du développement des algues brunes et l'acquisition de la multicellularité complexe. Sur un plan plus appliqué, ce projet a le potentiel de fournir de nouveaux outils moléculaires pour l'ingénierie de la haute production de biomasse chez les algues brunes, qui pourra être explorée pour la production d'une nouvelle génération de matériaux à valeur ajoutée pour l'alimentation humaine et animale, ainsi que d'autres applications industrielles, dans un contexte d'economie "bleue".