CELL2FISH Les fonction des Interferon Regulatory Factor 3/7 chez les poisson – CELL2FISH

Les Interferon Regulatory Factor (IRF) 3 et 7 sont des facteurs de transcription clé pour l'induction initiale d’interférons de type I (IFN1), principale cytokine antivirale orchestrant les réponses innées contre les virus. Leur mécanisme d'action est bien décrit chez les mammifères mais semble différent chez les poissons. En particulier, irf3 est un ISG chez les poissons mais pas chez l'homme, et les salmonidés ont deux paralogues d’irf7 (irf7-1 et irf7-2) pouvant expliquer les différences de mécanismes d'induction de l'IFN1. Nous avons récemment isolé une lignée cellulaire de salmonidés invalidée pour irf7-1 et irf7-2, qui présente une surprenante production constitutive d'IFN1 associée à une résistance spontanée à un certain nombre de virus. Ceci nous a conduit à émettre l'hypothèse que les voies de régulation d'irf3/7 chez les poissons sont distinctes du modèle canonique décrit chez les mammifères. Alors que des analyses phylogénétiques et d'expression d'irf3/7 ont été effectuées chez les poissons, l’impact de ces facteurs de transcription sur la cinétique et l'efficacité des réponses IFN1 contre les virus reste inconnu. Pour étudier cette question, nous combinerons nos outils in vitro (lignées cellulaires k.o.) à des modèles in vivo en utilisant des poissons k.o. irf3/7. Ces approches de perte de fonction seront développées dans deux familles de poissons : les cyprinidés (lignées cellulaires de poisson zèbre irf3 et 7 ko, de tête-de-boule irf3 et 7 ko) et les salmonidés (truite arc-en-ciel irf 7-1 et 7-2 ko, lignées cellulaires de saumon chinook irf3 et 7 ko). L’utilisation industrielle potentielle des lignées cellulaires et poissons mutants à phénotypes hypersensibles ou résistants aux infections virales, pour la production de vaccins, sera évaluée. Quatre partenaires, deux unités de recherche de l'INRAE (VIM, LPGP), une du CNRS/Institut Pasteur et une société commerciale (VIRBAC) aux expertises complémentaires feront équipe pour mener à bien ce projet.