Lumière sur les réseaux régulateurs de l'épissage d’ARN par les facteurs de transcription dans le développement tissulaire – TRren-D

Les facteurs de transcription (FT) sont des acteurs clés du destin cellulaire régulant l'expression des gènes dans des contextes cellulaires et développementaux précis. S’ils agissent à partir d'éléments ADN régulateurs, un concept émergent propose que les FTs se lient à l'ARN et modulent le devenir de l'ARNm aux niveaux de la transcription et de l'épissage. Toutefois, la contribution des fonctions d'épissage du FT dans la décision cellulaire est méconnue. L'épissage alternatif est un processus remarquable permettant la production de différents isoformes d'ARNm à partir d'un seul pré-ARNm. Il repose sur l'assemblage du spliceosome et de nombreuses protéines accessoires qui déterminent le destin de l'ARN dans des contextes cellulaires et développementaux précis. Un des mécanismes par lesquels les FTs coordonnent le destin cellulaire pourrait être par des interactions spécifiques avec les ARNm et la machinerie d'épissage. Pour tester cette hypothèse, nous déterminerons les programmes de régulation de l'ARN régulés par les FTs dans un contexte dynamique de développement tissulaire. Nous utiliserons le Hox FT Ultrabithorax (Ubx) de Drosophile comme modèle, pour lequel nous avons découvert une nouvelle fonction dans l'épissage. Ubx interagit avec des facteurs d'épissage in vivo dans différents tissus. De plus, Ubx module la transcription et l'épissage pour coordonner des fonctions distinctes dans le mésoderme d’embryons de drosophile. Ici, nous révélerons le profil de liaison à l’ARN et les réseaux protéique d'épissage de Ubx, par une approche intégrative de génétique, transcriptomique, protéomique et de modèle in silico pour reconstruire ces réseaux régulateurs dans le développement du muscle. En décryptant le rôle des FTs dans la morphogenèse centrée sur l'ARN, notre projet élargira notre compréhension des mécanismes moléculaires régulant l’élaboration des organismes multicellulaires.