Voies de Couplage des Contrôles de Qualité associés au Ribosome – RiboCoP

Les ARNm aberrants ou endommagés peuvent avoir un impact néfaste sur le fonctionnement cellulaire, et contribuent de manière significative au développement de situations pathologiques. Sur ces ARNm défectueux, les collisions entre ribosomes favorisent la dégradation des peptides naissants (PN), ainsi que celle des ARNms associés. L’absence de tels contrôles qualités peut conduire à la production de protéines incomplètes et dysfonctionnelles, ainsi qu’à la formation d'agrégats cellulaires potentiellement toxiques. Bien que notre compréhension des mécanismes conduisant à la dégradation des PN et des ARNm défectueux ait progressé, le couplage de ces deux voies de dégradation reste à élucider. Sur la base d'études préliminaires utilisant des rapporteurs dédiés à la détection de collisions de ribosomes dans des approches de génétique, de protéomique et d'imagerie, ce consortium a obtenu des preuves de l'existence de tels couplages, dont l'absence conduit à des voies alternatives de dégradation des peptides, et de leur possible compartimentation au sein de foyers cytoplasmiques. L'objectif de cette proposition est d'explorer le couplage spatio-temporel entre la dégradation des ARNm et des PN, et de caractériser plus avant les nouvelles voies de dégradation des PN. À cette fin, le consortium propose une approche multidisciplinaire combinant la génétique de la levure, l'analyse protéomique des complexes associés aux PN, l'étude structurale des ribosomes en collision par cryo-EM, et la biologie cellulaire. Dans leur ensemble, ces travaux devraient apporter un nouvel éclairage sur les voies de contrôle qualité associées aux ribosomes.