Facteurs cellulaires modulant la recombinaison – PolARe

La recombinaison homologue (RH) est un mécanisme ubiquitaire de réparation de l'ADN, essentiel au maintien de l'intégrité du génome, et clé dans la dynamique du génome en générant des conversions géniques associées ou non à des crossovers. La plupart des études mécanistiques sur la recombinaison homologue n’ont pas adressé en détail les effets du polymorphisme de séquence, une propriété du génome, ni de l'âge réplicatif et chronologique des cellules, propriétés de la cellule. Ici, nous aborderons ces thèmes principalement par la caractérisation des profils de recombinaison mitotique et méiotique à l'échelle du génome chez des hybrides de Saccharomyces cerevisiae construits à cet effet et possédant divers niveaux d'hétérozygotie. La comparaison des profils de recombinaison en présence et en absence de la machinerie de réparation des mésappariements (MMR) renseignera sur les types et densités de polymorphismes de séquence qui entraînent l'effet anti-recombinogène du MMR. A travers des expériences de vieillissement réplicatif et de vieillissement chronologique, la comparaison des profils de recombinaison des cellules jeunes et vieilles renseignera sur les défauts de recombinaison dans les cellules vieilles et leur implication dans l'instabilité génomique. Finalement, grâce à l'analyse de séquence autour des points chauds de recombinaison et autour des bordures des haplotypes dans la population de S. cerevisiae, nous projetterons nos résultats dans un cadre de génomique des populations pour déduire comment la recombinaison affecte l'évolution du génome et testerons nos prédictions par des approches d’édition du génome. Globalement, sur la base d’importants résultats préliminaires et d’une expertise éprouvée, nous avons l'ambition de déterminer les interactions entre Polymorphismes de séquences d’ADN, vieillissement et Recombinaison (PolARe).