Dégradation selective de petits ARN pendant l'élimination programmée du génome chez Paramecium – SELECTION

En raison de leur capacité à se déplacer dans le génome, les éléments transposables (ET) constituent une menace importante pour l'intégrité du génome. Pour limiter leur mobilisation, les eucaryotes utilisent des petits ARN (sARN) pour réduire au silence l'activité des ET via des mécanismes dépendants de l'homologie. Les sARN associés aux protéines PIWI recrutent des enzymes de modification des histones et répriment l'activité transcriptionnelle des ET. Cependant, la façon dont les complexes petits ARN-PIWI recrutent les effecteurs en aval reste mal comprise. Nous examinerons cette question importante en utilisant le paradigme de l'élimination du génome guidée par les petits ARN chez les ciliés. Chez le cilié Paramecium, l'élimination massive et reproductible des ET se produit pendant le développement du génome somatique à partir du génome germinal à chaque cycle sexuel. La reconnaissance spécifique des ET fait intervenir des sARN qui dirigent la formation d'hétérochromatine et l'élimination des ET. Les sARN sont produits à partir de l'ensemble du génome de la lignée germinale, pour les séquences ET et non-ET, par une voie d'ARN interférence spécifique du développement. Les sARN non-ET, qui représentent une large fraction de la population de sARN, sont dégradés, tandis que les sARN correspondant aux ET ne sont pas dégradés, recrutent le complexe répressif PRC2 et déclenchent l'élimination des ET. Notre programme de recherche a pour objectif de découvrir comment les ARNs non-ET sont sélectivement dégradés chez Paramecium, un modèle particulièrement bien adapté en raison de l'abondance et du moment précis du développement de la dégradation sélective des sARN. Nos résultats préliminaires ont identifié de nouveaux facteurs impliqués dans ce processus. Nous utiliserons des approches multidisciplinaires de pointe, combinant génomique fonctionnelle et protéomique, pour déchiffrer le mode d'action de ces facteurs et les voies impliquées.