Elucidation de l’effect du fonds génétique sur la diversité phénotypique au sein de la population naturelle – PopBack

L'élucidation de l'origine génétique de la diversité phénotypique au sein des populations naturelles reste un défi majeur en biologie. En effet, même une mutation dont l'impact fonctionnel est clairement défini peut conduire à une variété de phénotypes inattendus chez différents individus, à cause des effets secondaires des variants spécifiques aux fonds génétiques concernés. Bien que nous commencions à comprendre les causes de ces effets dans certains exemples particuliers, une vision globale de la manière dont le fonds génétique impacte la variation phénotypique au sein d'une espèce reste peu connu. Pour ce faire, la levure Saccharomyces cerevisiae peut être un modèle idéal, de par la disponibilité de grandes collections d'isolats naturels génétiquement diversifiés et d'outils génétiques se prêtant à des manipulations de laboratoire à haut débit. En profitant de ce système modèle, nous allons explorer les effets phénotypiques des mutations de perte de fonction à l'échelle du génome dans 1) des gènes uniques, 2) en combinaison avec des perturbations génétiques supplémentaires, ainsi que 3) en combinaison avec divers facteurs environnementaux, à travers un large panel d'isolats naturels de levure. Cela nous permettra d'obtenir une première vue d'ensemble du nombre, du type et des propriétés fonctionnelles des gènes présentant des phénotypes dépendant des fonds différents et de leurs architectures génétiques sous-jacentes à l’échelle de l'espèce. Cette quantité de données sans précédent permettra de mieux comprendre la relation génotype-phénotype, en particulier lorsque le génotype ne permet pas de prédire le phénotype.