Une approche 4D nucleome pour identifier les activateurs contrôlant la réponse au stress thermique de la tomat – 4D-Heat

La tomate est l'une des plus importantes cultures légumières pour la production et le commerce mondial. Sa consommation devrait augmenter de 60 % d'ici 2050, mais le changement climatique est un obstacle à l'augmentation des rendements. Dans ce contexte, les scientifiques doivent identifier les facteurs génomiques, et notamment les éléments régulateurs contrôlant l’expression des gènes responsables de la tolérance au stress. Dans cette optique, dans le cadre du projet 4D-HEAT, nous proposons de décrypter les mécanismes qui régissent la dynamique de contact entre les promoteurs et les séquences enhancers en réponse au stress thermique. Ce projet est très innovant car il intègre l'épigénome (1D), les données du transcriptome (2D) et l'architecture de la chromatine (3D) avec une dimension temporelle (4D) dans une approche globale pour comprendre comment s’établissent les contacts entre promoteurs et enhancers et également comment ces contacts affectent l'expression des gènes.